149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1901 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1901  transcriptional regulator, CarD family  100 
 
 		 159 aa  317  3.9999999999999996e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.488949  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00900  transcriptional regulator, CarD family  49.36 
 
 		 176 aa  173  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.92061e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4740  CarD family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 162 aa  170  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4826  CarD family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 162 aa  170  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.652741  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5126  CarD family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 162 aa  170  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.593452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0703  transcriptional regulator, CarD family  57.23 
 
 		 160 aa  169  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0540347  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03770  transcriptional regulator, CarD family  56.96 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0832449  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2907  CarD family transcriptional regulator  55.97 
 
 		 160 aa  167  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0259  transcriptional regulator, CarD family  49.68 
 
 		 158 aa  167  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000116082  normal  0.0229238 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0184  CarD family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 158 aa  166  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000461905  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1444  CarD family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 162 aa  166  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0898  transcriptional regulator, CarD family  54.72 
 
 		 160 aa  165  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4255  CarD family transcriptional regulator  55.35 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5340  CarD family transcriptional regulator  54.09 
 
 		 162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0362  CarD family transcriptional regulator  55.35 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0755625  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0185  CarD family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164199  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13616  transcription factor  54.09 
 
 		 162 aa  164  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0364  transcriptional regulator, CarD family  54.72 
 
 		 162 aa  163  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03720  transcriptional regulator, CarD family  52.83 
 
 		 160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2489  CarD family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00883814  normal  0.0681247 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0726  CarD family transcriptional regulator  54.09 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0852  transcriptional regulator, CarD family  54.09 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2959  transcriptional regulator, CarD family  53.46 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0601  transcriptional regulator, CarD family  52.83 
 
 		 162 aa  161  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0651  transcriptional regulator, CarD family  53.46 
 
 		 160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31820  transcriptional regulator, CarD family  53.46 
 
 		 160 aa  160  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35090  transcriptional regulator, CarD family  54.43 
 
 		 163 aa  160  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.86286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09270  transcriptional regulator, CarD family  53.46 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0399  transcriptional regulator, CarD family  50 
 
 		 159 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00433509  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0773  transcriptional regulator, CarD family  52.83 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164526  normal  0.216229 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4040  CarD family transcriptional regulator  54.37 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2940  CarD family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0963  CarD family transcriptional regulator  53.8 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4319  transcriptional regulator, CarD family  53.46 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0501  CarD family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 163 aa  158  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2077  transcriptional regulator, CarD family  51.57 
 
 		 161 aa  158  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.90671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0164  transcriptional regulator, CarD family  46.79 
 
 		 161 aa  157  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.475576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0866  transcriptional regulator, CarD family  52.83 
 
 		 160 aa  157  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.795809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4262  transcription factor CarD  52.53 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4692  CarD family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0663  transcriptional regulator, CarD family  54.72 
 
 		 160 aa  153  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471723  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1687  transcriptional regulator, CarD family  46.54 
 
 		 171 aa  152  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal  0.385121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0142  transcriptional regulator, CarD family  52.2 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.432895  normal  0.208842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8145  transcriptional regulator, CarD family  54.72 
 
 		 160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0078  CarD family transcriptional regulator  53.46 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0340  transcriptional regulator, CarD family  42.31 
 
 		 159 aa  148  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.18012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0392  transcriptional regulator, CarD family  44.59 
 
 		 158 aa  148  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000362697  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0970  transcription factor CarD  48.43 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0421613  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0173  transcriptional regulator, CarD family  41.4 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0751  transcriptional_regulator  45 
 
 		 197 aa  127  6e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024387  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0598  CarD-like protein  44.1 
 
 		 198 aa  127  9.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.80876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4522  transcriptional regulator, CarD family  41.14 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2498  CarD family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 171 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860997  hitchhiker  0.00028149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1245  transcriptional regulator, CarD family  39.51 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000622315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3655  CarD family transcriptional regulator  38 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000563805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1271  CarD family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 171 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0355661  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2685  transcriptional regulator, CarD family  37.42 
 
 		 171 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000114953  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2592  transcriptional regulator, CarD family  37.42 
 
 		 171 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0112448  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0104  putative transcriptional regulator  38.73 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3388  CarD family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4857  CarD family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4851  transcriptional regulator, CarD family  32.43 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.906261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4447  CarD family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.948938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4833  transcriptional regulator, CarD family  31.41 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4465  CarD family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 164 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4827  transcriptional regulator, CarD family  32.43 
 
 		 164 aa  103  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0409  transcriptional regulator, CarD family  31.76 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4546  CarD family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4611  CarD family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4967  CarD family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0352786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3244  CarD family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0553  CarD family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 186 aa  95.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.106892 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3335  CarD family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1065  CarD family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 153 aa  94  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0695746  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2821  CarD family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 188 aa  92.8  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3201  transcriptional regulator, CarD family  34.44 
 
 		 174 aa  91.7  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3676  CarD family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2124  transcriptional regulator, CarD family  30.38 
 
 		 161 aa  88.2  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0696719  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2290  transcriptional regulator, putative  30.92 
 
 		 208 aa  87  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2164  transcriptional regulator, CarD family  31.39 
 
 		 153 aa  87  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1516  transcriptional regulator, CarD family  31.41 
 
 		 191 aa  87  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1561  CarD family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0294353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0676  transcriptional regulator, CarD family  38.19 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000026469  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1560  transcriptional regulator, CarD family  30.66 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.879343  normal  0.22005 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3438  CarD family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.270269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3350  CarD family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2129  CarD family transcriptional regulator  34 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000417327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3708  CarD family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3756  transcriptional regulator, CarD family  30.66 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3658  transcriptional regulator, CarD family  30.66 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2880  CarD family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3401  CarD family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 158 aa  84  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3681  transcriptional regulator, CarD family  29.93 
 
 		 158 aa  84  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0786327  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2613  transcriptional regulator, CarD family  35.53 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0247  CarD family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.246568 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0842  transcriptional regulator, CarD family  31.82 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000502927  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0124  CarD family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 174 aa  80.5  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2296  CarD family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 169 aa  80.5  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000229013  normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0490  transcriptional regulator, CarD family  33.77 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00257809 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4112  CarD family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00258914  normal  0.616295 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>