More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1848 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  100 
 
 
414 aa  834    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  59.4 
 
 
454 aa  492  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  57.64 
 
 
412 aa  487  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  58.13 
 
 
437 aa  485  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  58.27 
 
 
432 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  58.27 
 
 
432 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  57.39 
 
 
430 aa  478  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  57.53 
 
 
434 aa  481  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  57.89 
 
 
441 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  58.1 
 
 
408 aa  476  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  58.5 
 
 
437 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  59.85 
 
 
425 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  58.85 
 
 
425 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  57.36 
 
 
428 aa  444  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  55.86 
 
 
429 aa  441  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  57.07 
 
 
416 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  56.61 
 
 
419 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  56.86 
 
 
411 aa  435  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  58.06 
 
 
418 aa  434  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  56.14 
 
 
424 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  56.36 
 
 
429 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  54.57 
 
 
418 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  55.04 
 
 
416 aa  425  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  55.22 
 
 
428 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  56.75 
 
 
413 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  54.84 
 
 
421 aa  421  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  53.12 
 
 
439 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  56.05 
 
 
420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  54.73 
 
 
428 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  47.47 
 
 
404 aa  366  1e-100  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  51.83 
 
 
426 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  49.88 
 
 
424 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  38.58 
 
 
403 aa  280  4e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  38.32 
 
 
404 aa  279  8e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  37.8 
 
 
404 aa  277  3e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  36.27 
 
 
404 aa  276  4e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  38.32 
 
 
404 aa  276  6e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  37.05 
 
 
421 aa  275  1.0000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  37.56 
 
 
405 aa  269  7e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  38.24 
 
 
414 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  36.48 
 
 
416 aa  256  6e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  38.27 
 
 
401 aa  249  6e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  38.28 
 
 
401 aa  243  7e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  36.45 
 
 
399 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  35.58 
 
 
402 aa  231  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  34.35 
 
 
403 aa  228  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  35.19 
 
 
419 aa  226  8e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  34.98 
 
 
401 aa  224  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  34.36 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  37.72 
 
 
422 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  31.02 
 
 
403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  34.26 
 
 
405 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  34.35 
 
 
396 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  37.31 
 
 
402 aa  213  7e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  36.29 
 
 
427 aa  211  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  37.34 
 
 
419 aa  212  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  36.48 
 
 
423 aa  208  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  36.52 
 
 
408 aa  207  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  37.76 
 
 
459 aa  204  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.03 
 
 
415 aa  204  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  41.03 
 
 
345 aa  203  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1218  response regulator receiver protein  35.25 
 
 
545 aa  199  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  37.99 
 
 
351 aa  197  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  37.54 
 
 
356 aa  197  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  40.96 
 
 
348 aa  197  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  39.26 
 
 
354 aa  196  6e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  32.32 
 
 
402 aa  196  6e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  37.8 
 
 
352 aa  196  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  39.56 
 
 
353 aa  196  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  39.56 
 
 
353 aa  196  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  38.7 
 
 
346 aa  196  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2895  threonine synthase  39.2 
 
 
353 aa  196  9e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0411595  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  38.72 
 
 
352 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  34.79 
 
 
432 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  38.41 
 
 
352 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  38.41 
 
 
352 aa  193  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  37.85 
 
 
346 aa  193  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  37.64 
 
 
348 aa  193  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  38.41 
 
 
352 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  38.41 
 
 
352 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  38.41 
 
 
352 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  38.11 
 
 
352 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  38.79 
 
 
352 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  38.41 
 
 
352 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0058  threonine synthase  36.95 
 
 
404 aa  190  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  34.55 
 
 
371 aa  190  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  35.37 
 
 
397 aa  189  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  39.7 
 
 
348 aa  189  5e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3356  threonine synthase  38.41 
 
 
352 aa  189  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000444618  hitchhiker  0.0000000000000127983 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  36.8 
 
 
352 aa  188  1e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3040  threonine synthase  41.23 
 
 
353 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  37.57 
 
 
363 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  40.12 
 
 
362 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  39.08 
 
 
351 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  34.71 
 
 
351 aa  188  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  35.68 
 
 
366 aa  186  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  32.29 
 
 
422 aa  186  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3724  threonine synthase  39.33 
 
 
377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0780152  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  33.94 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  40.3 
 
 
359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>