197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1834 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  100 
 
 
283 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  58.12 
 
 
301 aa  329  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  57.14 
 
 
310 aa  321  8e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  54.32 
 
 
314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  54.45 
 
 
294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  53.74 
 
 
294 aa  301  9e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  54.26 
 
 
294 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  53.55 
 
 
294 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  55 
 
 
291 aa  296  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  55.63 
 
 
300 aa  295  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  53.55 
 
 
294 aa  294  9e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  52.8 
 
 
296 aa  290  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  58.15 
 
 
294 aa  288  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  53.52 
 
 
311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  52.96 
 
 
293 aa  284  9e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  55.75 
 
 
299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  53.15 
 
 
303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  53.17 
 
 
300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  52.05 
 
 
299 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  52.63 
 
 
288 aa  281  8.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  51.6 
 
 
294 aa  279  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  51.72 
 
 
291 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  53.66 
 
 
289 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  51.92 
 
 
300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8358  acyl-CoA thioesterase II  56.66 
 
 
288 aa  272  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  51.57 
 
 
287 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  50 
 
 
291 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  49.66 
 
 
286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  51.22 
 
 
287 aa  268  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  49.66 
 
 
293 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  48.77 
 
 
289 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  51.05 
 
 
292 aa  265  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  48.42 
 
 
289 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  48.98 
 
 
291 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  48.59 
 
 
289 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  48.97 
 
 
291 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  48.75 
 
 
286 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2964  acyl-CoA thioesterase  55.93 
 
 
293 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  47.16 
 
 
326 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  49.29 
 
 
277 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  47.02 
 
 
289 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  48.25 
 
 
290 aa  252  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  47.02 
 
 
289 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  47.04 
 
 
289 aa  250  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  48.03 
 
 
301 aa  246  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  49.08 
 
 
289 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  48.71 
 
 
289 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  48.24 
 
 
314 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  46.83 
 
 
286 aa  244  9e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  46.43 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  48.34 
 
 
289 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2137  acyl-CoA thioesterase II  51.58 
 
 
288 aa  242  6e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174647  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  47.24 
 
 
288 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  48.34 
 
 
289 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  47.74 
 
 
287 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  43.4 
 
 
289 aa  240  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  48.94 
 
 
306 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  47.24 
 
 
288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  47.24 
 
 
288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  47.06 
 
 
288 aa  239  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  46.55 
 
 
288 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  46.55 
 
 
288 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  46.55 
 
 
288 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  46.53 
 
 
287 aa  238  8e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  46.55 
 
 
288 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  46.21 
 
 
288 aa  237  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  46.9 
 
 
288 aa  235  7e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  46.58 
 
 
288 aa  235  7e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  46.02 
 
 
286 aa  234  8e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  43.51 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2565  acyl-CoA thioesterase II  46.48 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  47.2 
 
 
286 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  47.2 
 
 
286 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  47.2 
 
 
286 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3831  acyl-CoA thioesterase II  46.5 
 
 
282 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2939  acyl-CoA thioesterase  40.93 
 
 
292 aa  230  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  43.79 
 
 
287 aa  229  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  46.15 
 
 
288 aa  229  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0838  acyl-CoA thioesterase  44.33 
 
 
268 aa  229  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  43.16 
 
 
286 aa  228  8e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  43.16 
 
 
286 aa  228  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  43.16 
 
 
286 aa  228  8e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  43.16 
 
 
286 aa  228  8e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  43.16 
 
 
286 aa  228  8e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  43.16 
 
 
286 aa  228  8e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  43.16 
 
 
286 aa  228  8e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  43.16 
 
 
286 aa  228  8e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2666  palmitoyl-CoA hydrolase  44.52 
 
 
305 aa  228  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  43.16 
 
 
286 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08940  acyl-CoA thioesterase  43.53 
 
 
323 aa  226  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.271356  normal  0.0733048 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2238  Acyl-CoA thioesterase  44.91 
 
 
284 aa  226  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58681  hitchhiker  0.0000000000102544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2297  acyl-CoA thioesterase  45.71 
 
 
284 aa  225  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1368  palmitoyl-CoA hydrolase  45.52 
 
 
289 aa  225  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  43.4 
 
 
286 aa  225  7e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  44.29 
 
 
286 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  44.29 
 
 
286 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  44.49 
 
 
286 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  43.94 
 
 
286 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  43.94 
 
 
286 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  43.94 
 
 
286 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>