More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1778 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  57.66 
 
 		 1131 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  57.06 
 
 		 1111 aa  638    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  56.73 
 
 		 1106 aa  646    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  56.46 
 
 		 1154 aa  646    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  56.51 
 
 		 1088 aa  667    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  57.86 
 
 		 1160 aa  650    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  58.01 
 
 		 1136 aa  658    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  57.27 
 
 		 1106 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  61.91 
 
 		 596 aa  695    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  56.75 
 
 		 1101 aa  659    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  58.26 
 
 		 1108 aa  677    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  58.33 
 
 		 1100 aa  665    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  100 
 
 		 558 aa  1138    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  57.53 
 
 		 587 aa  641    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  56.73 
 
 		 1106 aa  646    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  59.21 
 
 		 553 aa  680    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  62.68 
 
 		 604 aa  706    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  57.48 
 
 		 1131 aa  650    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  57.71 
 
 		 1108 aa  671    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  63.3 
 
 		 606 aa  717    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  56.88 
 
 		 1121 aa  648    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  56.99 
 
 		 588 aa  660    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  56.28 
 
 		 1094 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  56.33 
 
 		 1104 aa  654    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  57.22 
 
 		 1113 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  58.12 
 
 		 551 aa  677    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  57.14 
 
 		 1088 aa  665    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  57.86 
 
 		 1102 aa  657    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  57.54 
 
 		 1138 aa  653    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  62.86 
 
 		 610 aa  724    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  56.17 
 
 		 1109 aa  653    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09530  trehalose synthase  57.35 
 
 		 616 aa  640    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126858  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  57.69 
 
 		 1093 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  57.17 
 
 		 1112 aa  650    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  57.27 
 
 		 1110 aa  647    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  56 
 
 		 585 aa  653    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  57.14 
 
 		 1123 aa  643    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  64.29 
 
 		 572 aa  725    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  56.67 
 
 		 1100 aa  640    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  57.66 
 
 		 1131 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  57.09 
 
 		 1100 aa  640    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  57.66 
 
 		 1131 aa  652    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  59.61 
 
 		 572 aa  699    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  57.49 
 
 		 1100 aa  660    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  64.29 
 
 		 574 aa  719    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  59.96 
 
 		 572 aa  701    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  57.3 
 
 		 1100 aa  650    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  56.51 
 
 		 1152 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  57.86 
 
 		 1102 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  55.62 
 
 		 1112 aa  649    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  58.04 
 
 		 1102 aa  661    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  57.07 
 
 		 1099 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  57.84 
 
 		 1108 aa  658    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  57.92 
 
 		 551 aa  660    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  55.52 
 
 		 1154 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  56.78 
 
 		 1110 aa  645    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  58.09 
 
 		 1137 aa  661    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  57.12 
 
 		 1100 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  56.15 
 
 		 1092 aa  665    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  56.28 
 
 		 1088 aa  661    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  55.96 
 
 		 1088 aa  663    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  57.96 
 
 		 1101 aa  652    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  55.99 
 
 		 1108 aa  635    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  56.96 
 
 		 1100 aa  655    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  59.2 
 
 		 591 aa  664    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  57.66 
 
 		 1131 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  61.51 
 
 		 601 aa  704    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  58.09 
 
 		 1137 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  57.61 
 
 		 567 aa  635    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  61.91 
 
 		 596 aa  696    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  55.6 
 
 		 1121 aa  657    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  64.4 
 
 		 567 aa  726    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  56.27 
 
 		 1115 aa  656    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  56.33 
 
 		 1139 aa  638    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  57.88 
 
 		 1088 aa  668    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  58.09 
 
 		 1137 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  56.29 
 
 		 598 aa  645    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  64.95 
 
 		 601 aa  734    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  56.51 
 
 		 1088 aa  667    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  59.11 
 
 		 548 aa  661    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  58.27 
 
 		 1137 aa  660    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  58.51 
 
 		 1100 aa  667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  56.23 
 
 		 1142 aa  651    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  57.89 
 
 		 1100 aa  671    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  60.44 
 
 		 553 aa  699    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  61.57 
 
 		 562 aa  701    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  57.12 
 
 		 1164 aa  645    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  54.55 
 
 		 1085 aa  638    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  57.66 
 
 		 1131 aa  652    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  55.76 
 
 		 598 aa  646    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  54.8 
 
 		 1114 aa  646    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  57.75 
 
 		 1093 aa  658    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  58.09 
 
 		 1137 aa  662    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  57.27 
 
 		 1105 aa  650    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  64.33 
 
 		 556 aa  726    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3091  trehalose synthase  61.66 
 
 		 582 aa  701    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000061423  hitchhiker  0.00000215015 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  57.12 
 
 		 1164 aa  645    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  60.98 
 
 		 571 aa  697    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  54.63 
 
 		 1094 aa  639    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  57.64 
 
 		 1119 aa  653    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>