More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1768 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  100 
 
 
451 aa  902    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2510  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  57.68 
 
 
455 aa  491  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3760  Phosphomannomutase  57.46 
 
 
453 aa  478  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5858  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  58.2 
 
 
453 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0751  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  57.3 
 
 
452 aa  474  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.648752  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6327  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  55.93 
 
 
450 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.428689  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0756  Phosphomannomutase  56.35 
 
 
451 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  56.67 
 
 
451 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1187  Phosphomannomutase  53.56 
 
 
456 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1387  Phosphomannomutase  55.73 
 
 
450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0465  phosphomannomutase  53.91 
 
 
454 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441417  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1425  phosphomannomutase  56.03 
 
 
469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.896243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7604  Phosphomannomutase  55.93 
 
 
449 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4298  Phosphomannomutase  55.56 
 
 
454 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4168  Phosphomannomutase  54.87 
 
 
471 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.400371  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4063  Phosphomannomutase  56.57 
 
 
456 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0919518  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  50.79 
 
 
472 aa  435  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3841  Phosphomannomutase  51.05 
 
 
497 aa  433  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0898  phosphomannomutase  52.31 
 
 
461 aa  428  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478971  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6010  Phosphomannomutase  51.88 
 
 
454 aa  415  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.30884  normal  0.056179 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13286  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  52.57 
 
 
465 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.489635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1328  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  52.13 
 
 
465 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23364  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4726  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  52.02 
 
 
465 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267989  normal  0.336703 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1345  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  52.13 
 
 
465 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1737  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  51.58 
 
 
464 aa  413  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.847298  normal  0.689022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1364  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  51.56 
 
 
465 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176475  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0961  phosphomannomutase  52.75 
 
 
461 aa  411  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.386078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2542  Phosphomannomutase  49.38 
 
 
488 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0671  phosphomannomutase  49.13 
 
 
475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.828766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0818  Phosphomannomutase  49.57 
 
 
472 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1856  Phosphomannomutase  49.8 
 
 
502 aa  403  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114337  decreased coverage  0.00605536 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  46.83 
 
 
446 aa  395  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08560  phosphomannomutase  48.53 
 
 
487 aa  392  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03540  phosphomannomutase  47.48 
 
 
491 aa  392  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  46.15 
 
 
447 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09120  phosphomannomutase  48.37 
 
 
529 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.187509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  47.19 
 
 
448 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3585  Phosphomannomutase  46.7 
 
 
479 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1952  phosphomannomutase  50.61 
 
 
414 aa  365  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.322718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  45.84 
 
 
448 aa  360  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  45.01 
 
 
456 aa  352  8.999999999999999e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20740  phosphomannomutase  45.87 
 
 
592 aa  347  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00626227  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0895  Phosphomannomutase  42.02 
 
 
456 aa  342  9e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310909  hitchhiker  0.000000688858 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  44.89 
 
 
444 aa  340  2e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3280  Phosphomannomutase  42.79 
 
 
454 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3126  phosphomannomutase  41.44 
 
 
461 aa  339  8e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141531  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0863  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  43.92 
 
 
813 aa  334  2e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2662  phosphomannomutase  40.67 
 
 
456 aa  332  6e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0392975  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1432  Phosphomannomutase  42.22 
 
 
453 aa  332  8e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1118  phosphomannomutase  41.02 
 
 
454 aa  332  1e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000519382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3151  Phosphomannomutase  40.09 
 
 
450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1779  phosphomannomutase ManB  40.94 
 
 
450 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1600  phosphomannomutase  40 
 
 
455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455813  normal  0.713517 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2337  phosphomannomutase  40.67 
 
 
456 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113042  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1792  phosphomannomutase  41.03 
 
 
450 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2643  phosphomannomutase  40.27 
 
 
457 aa  326  5e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320582  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2286  phosphomannomutase  40.67 
 
 
456 aa  326  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1134  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain III  40 
 
 
450 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01932  Phosphomannomutase  40.97 
 
 
454 aa  324  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1014  phosphomannomutase  42.23 
 
 
456 aa  323  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2964  phosphomannomutase  42 
 
 
456 aa  323  4e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000327344 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1677  phosphomannomutase  40.79 
 
 
457 aa  323  4e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2229  phosphomannomutase  40.44 
 
 
456 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117299  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2589  Phosphomannomutase  40.27 
 
 
447 aa  323  5e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1593  phosphomannomutase  42.23 
 
 
456 aa  322  6e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.014113  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2982  phosphomannomutase  42 
 
 
456 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140295 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01954  phosphomannomutase  42 
 
 
456 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0099894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1609  Phosphomannomutase  42 
 
 
456 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000012475  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2330  phosphomannomutase  40.44 
 
 
456 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0469689 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01943  hypothetical protein  42 
 
 
456 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00870446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2340  phosphomannomutase  41.76 
 
 
456 aa  320  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0458  phosphomannomutase  40 
 
 
450 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235202  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2444  phosphomannomutase  40.22 
 
 
456 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188854 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1184  phosphomannomutase  41.76 
 
 
456 aa  319  7.999999999999999e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3178  phosphomannomutase  38.44 
 
 
457 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1317  Phosphomannomutase  38.8 
 
 
457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214391  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3037  phosphomannomutase  38.44 
 
 
457 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.848364  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1777  phosphomannomutase  39.73 
 
 
453 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1256  phosphomannomutase  38.44 
 
 
457 aa  313  5.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000453708  hitchhiker  0.000000000293956 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0509  Phosphomannomutase  41.12 
 
 
448 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0115906 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1093  Phosphomannomutase  42.08 
 
 
448 aa  310  5e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03174  phosphohexose mutase  40.45 
 
 
448 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0200  phosphomannomutase  39.41 
 
 
449 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0229  phosphomannomutase  39.41 
 
 
449 aa  307  3e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1384  phosphomannomutase  40.79 
 
 
453 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2851  Phosphomannomutase  40.13 
 
 
457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1900  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  41.63 
 
 
456 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.662048  hitchhiker  0.0000555961 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0489  Phosphomannomutase  36.88 
 
 
493 aa  301  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2172  phosphomannomutase  39.81 
 
 
460 aa  299  6e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.140706  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0302  phosphomannomutase  37.75 
 
 
470 aa  298  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0032  phosphomannomutase  35.6 
 
 
439 aa  297  3e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.457022  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0120  phosphomannomutase  37.82 
 
 
497 aa  296  6e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0111  phosphomannomutase  38.7 
 
 
493 aa  296  7e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2492  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  39.87 
 
 
458 aa  294  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.211242  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0274  phosphomannomutase  38.79 
 
 
487 aa  294  3e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000825  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1793  phosphomannomutase  35.79 
 
 
481 aa  293  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302913  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0835  phosphomannomutase  39.87 
 
 
458 aa  293  6e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584316  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1001  phosphomannomutase  37.42 
 
 
453 aa  293  6e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834887  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2109  Phosphomannomutase  38.34 
 
 
467 aa  292  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221501  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2255  Phosphomannomutase  42.02 
 
 
450 aa  291  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0395092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>