More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1745 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1745  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
358 aa  690    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1744  glycosyl transferase group 1  36.45 
 
 
348 aa  145  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  35.32 
 
 
1233 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0374  glycosyltransferase  23.42 
 
 
351 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4199  glycosyl transferase, group 1  28.66 
 
 
368 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  40.97 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2136  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 
1267 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
1267 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
376 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2630  glycosyl transferase group 1  36.41 
 
 
438 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451665  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  38.85 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2760  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
1039 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  36.47 
 
 
378 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
442 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  32.57 
 
 
373 aa  63.9  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 
370 aa  63.9  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
364 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
382 aa  63.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
389 aa  63.5  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 
364 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
343 aa  63.5  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
354 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  29.58 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
361 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  31.62 
 
 
364 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  33.93 
 
 
364 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  33.53 
 
 
370 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  32.84 
 
 
378 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
386 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  30 
 
 
375 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  33.16 
 
 
378 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
382 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  30 
 
 
375 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  25.09 
 
 
389 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
337 aa  60.1  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 
349 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
384 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  33.56 
 
 
416 aa  59.7  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
402 aa  59.3  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  35.25 
 
 
482 aa  59.3  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
376 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
423 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  34.06 
 
 
366 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  26.88 
 
 
372 aa  58.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  26.88 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
402 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  33.11 
 
 
371 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  23.73 
 
 
378 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  26.4 
 
 
430 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
1241 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  33.2 
 
 
385 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2749  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 
344 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  36.3 
 
 
371 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  34.19 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  36.69 
 
 
356 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  36.13 
 
 
448 aa  57.8  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
361 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
372 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4162  glycosyl transferase group 1  39.2 
 
 
347 aa  57  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0349192  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 
392 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0757  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 
404 aa  57.4  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
373 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  35.21 
 
 
450 aa  57  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
378 aa  57  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
376 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 
360 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 
357 aa  57  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1410  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 
384 aa  57  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00834498 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
393 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0101  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.15 
 
 
501 aa  57  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
443 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 
448 aa  56.6  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1630  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 
418 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  35.56 
 
 
384 aa  56.2  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
419 aa  56.2  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3664  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
346 aa  56.2  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.032207  normal  0.177473 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
387 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
387 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
382 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  34.97 
 
 
428 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0772  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 
358 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494029  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
435 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
376 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.17 
 
 
369 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 
433 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
355 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
374 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 
370 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  28.06 
 
 
1232 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1878  starch synthase  33.99 
 
 
482 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
838 aa  54.3  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0044  glycosyltransferase  41.54 
 
 
353 aa  54.7  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>