51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1639 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1639  peptidase S51 dipeptidase E  100 
 
 
234 aa  461  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0221  peptidase S51 dipeptidase E  32.89 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  30.81 
 
 
274 aa  61.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  30.26 
 
 
611 aa  59.3  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  30.91 
 
 
273 aa  58.5  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0616  cyanophycinase  33.33 
 
 
293 aa  58.5  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0275965  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4859  cyanophycinase  35.46 
 
 
327 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.600302 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13540  cyanophycinase  31.25 
 
 
328 aa  56.6  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.500388  normal  0.709698 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5801  cyanophycinase  32.12 
 
 
281 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  30 
 
 
269 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0740  peptidase S51 dipeptidase E  30.13 
 
 
339 aa  55.5  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141411  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1964  cyanophycinase  32.68 
 
 
291 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  26.67 
 
 
273 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1351  cyanophycinase  30.05 
 
 
269 aa  52.4  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2188  cyanophycinase  29.3 
 
 
275 aa  52.4  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2478  cyanophycinase  28.03 
 
 
278 aa  52  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  32.28 
 
 
287 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  32.28 
 
 
287 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0337  cyanophycinase. Serine peptidase. MEROPS family S51  29.82 
 
 
288 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.504841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2760  cyanophycinase  28.57 
 
 
280 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1442  peptidase E  26.89 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000003694  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1900  hypothetical protein  22.41 
 
 
232 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000489032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1788  hypothetical protein  23.01 
 
 
232 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1420  peptidase S51 dipeptidase E  26.01 
 
 
232 aa  48.9  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  31.52 
 
 
294 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1847  hypothetical protein  22.41 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174476  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0972  peptidase E  34.83 
 
 
159 aa  48.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1113  cyanophycinase  28.47 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3556  hypothetical protein  22.18 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.230544  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  27.23 
 
 
269 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1592  peptidase E  22.41 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1642  peptidase S51 dipeptidase E  30.56 
 
 
232 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5501  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4955  cyanophycinase  29.24 
 
 
284 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0438  peptidase S51, dipeptidase E  27.39 
 
 
323 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148568  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1621  peptidase S51 dipeptidase E  26.88 
 
 
317 aa  45.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2497  peptidase S51, dipeptidase E  26.11 
 
 
231 aa  45.8  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  25.55 
 
 
204 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  34.04 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1121  peptidase S51 dipeptidase E  27.57 
 
 
340 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  hitchhiker  0.00178513 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0172  cyanophycinase  29.55 
 
 
278 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0803268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  26.7 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1643  hypothetical protein  21.99 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1094  peptidase S51 dipeptidase E  30.89 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0707899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1774  hypothetical protein  21.99 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1824  hypothetical protein  21.99 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1622  peptidase E  21.99 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1870  cyanophycinase  27.4 
 
 
274 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2319  peptidase S51, dipeptidase E  26.62 
 
 
242 aa  42.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4154  cyanophycinase  23.74 
 
 
279 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0514  cyanophycinase  26.97 
 
 
291 aa  42  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.226202  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  29.41 
 
 
289 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>