48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1635 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1635  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
184 aa  368  1e-101  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20770  DNA-binding protein, excisionase family  58.06 
 
 
170 aa  176  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04840  DNA-binding protein, excisionase family  50.41 
 
 
157 aa  121  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287147  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1856  excisionase/Xis, DNA-binding  45.24 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13782  excisionase  51.96 
 
 
130 aa  102  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.696326 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03470  DNA-binding protein, excisionase family  34.76 
 
 
178 aa  94.7  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3752  DNA binding domain protein, excisionase family  37.8 
 
 
153 aa  93.2  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  43.33 
 
 
136 aa  89  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  40.68 
 
 
153 aa  87.8  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4162  DNA binding domain-containing protein  39.53 
 
 
155 aa  87.4  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766794  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  41.84 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4630  DNA binding domain-containing protein  41.75 
 
 
109 aa  84  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3385  DNA binding domain-containing protein  36.29 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3239  putative excisionase protein  39.22 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0263514 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3279  DNA binding domain-containing protein  33.78 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746198  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0695  DNA binding domain-containing protein  40.18 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0623453  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3464  DNA binding domain protein, excisionase family  37.86 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1614  excisionase domain protein  40.95 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177236  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4367  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.264021  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0234  DNA binding domain protein, excisionase family  40.95 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.844329  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1445  DNA binding domain protein, excisionase family  36.09 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2344  excisionase/Xis, DNA-binding  35.24 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000412399  unclonable  0.000000144936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1265  DNA binding domain-containing protein  35.24 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7903  DNA binding domain protein, excisionase family  37.37 
 
 
151 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4424  excisionase/Xis, DNA-binding  38.78 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412812  normal  0.513103 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  34.21 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0338  DNA binding domain-containing protein  41.18 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4763  excisionase/Xis, DNA-binding  35.71 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4435  DNA binding domain-containing protein  28.57 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.901637  normal  0.560095 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3978  DNA binding domain-containing protein  33.98 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.382776 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12334  excisionase  42.55 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4151  excisionase domain-containing protein  33.96 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1776  excisionase/Xis, DNA-binding  36.67 
 
 
97 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666085  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  36.89 
 
 
151 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3978  DNA binding domain-containing protein  36.63 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8221  DNA binding domain-containing protein  39.33 
 
 
149 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2889  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  29.27 
 
 
167 aa  57.8  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3272  DNA binding domain protein, excisionase family  34.18 
 
 
143 aa  52.4  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0072  DNA binding domain protein, excisionase family  35.56 
 
 
141 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0804  regulatory protein MerR  31.37 
 
 
132 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4008  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 
132 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0793  DNA binding domain protein, excisionase family  45.9 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3800  DNA binding domain protein, excisionase family  29.23 
 
 
171 aa  44.7  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0848  DNA binding domain protein, excisionase family  31.48 
 
 
127 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0405  excisionase/Xis, DNA-binding  48 
 
 
63 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  46 
 
 
64 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  46 
 
 
64 aa  42  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  46 
 
 
64 aa  40.8  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>