More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1597 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
323 aa  646    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338199  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1946  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.27 
 
 
325 aa  377  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8607  Ribose-phosphate diphosphokinase  57.59 
 
 
325 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0169  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.41 
 
 
326 aa  368  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32370  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.66 
 
 
326 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531624  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3154  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.96 
 
 
326 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.911142  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0769  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.91 
 
 
324 aa  361  9e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.65 
 
 
325 aa  360  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1052  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.28 
 
 
325 aa  359  4e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1015  ribose-phosphate diphosphokinase  56.7 
 
 
344 aa  358  7e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0987  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.65 
 
 
326 aa  358  8e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257813 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.17 
 
 
322 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3962  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.59 
 
 
324 aa  354  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.87 
 
 
326 aa  353  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1943  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.75 
 
 
326 aa  351  8e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.985471 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4628  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.11 
 
 
326 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.38327  normal  0.568111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4249  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.11 
 
 
326 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4335  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.11 
 
 
326 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.43 
 
 
326 aa  350  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.65 
 
 
326 aa  349  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0415  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.49 
 
 
322 aa  348  5e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00469729  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05480  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.06 
 
 
326 aa  347  1e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1290  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.83 
 
 
326 aa  345  6e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3195  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.63 
 
 
325 aa  345  7e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1218  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.11 
 
 
326 aa  345  7e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0881  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.75 
 
 
327 aa  344  1e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.328682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0789  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.33 
 
 
326 aa  343  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0909  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
347 aa  343  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11035  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.94 
 
 
326 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30170  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.75 
 
 
327 aa  342  5e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.35865  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13390  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.85 
 
 
326 aa  341  1e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.271989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0656  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.48 
 
 
323 aa  340  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.11 
 
 
327 aa  338  8e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1288  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.85 
 
 
326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000959513 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03490  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.38 
 
 
334 aa  335  3.9999999999999995e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.489296  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.13 
 
 
315 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0717  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.95 
 
 
316 aa  334  1e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.156805  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.66 
 
 
324 aa  332  4e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2708  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.37 
 
 
327 aa  331  1e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1545  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.27 
 
 
325 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.317921  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.28 
 
 
325 aa  328  6e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.96 
 
 
316 aa  328  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.78 
 
 
337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1175  ribose-phosphate diphosphokinase  49.37 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.475519 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.53 
 
 
321 aa  325  5e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03970  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 
321 aa  325  5e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.579813 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.66 
 
 
331 aa  324  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
319 aa  324  2e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.45 
 
 
317 aa  323  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.21 
 
 
319 aa  322  5e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.89 
 
 
319 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.2 
 
 
313 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.58 
 
 
316 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.65 
 
 
322 aa  316  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.52 
 
 
329 aa  316  4e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.13 
 
 
318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.24 
 
 
340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0702588  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
315 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
315 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.55 
 
 
317 aa  311  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  48.24 
 
 
327 aa  310  2e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
318 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
318 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.55 
 
 
317 aa  309  5e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.36 
 
 
338 aa  306  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.52 
 
 
316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.58 
 
 
330 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.56 
 
 
315 aa  306  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.41 
 
 
322 aa  305  6e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  49.04 
 
 
317 aa  305  9.000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.26 
 
 
338 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  50.79 
 
 
312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.75 
 
 
331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0342  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.14 
 
 
331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.24 
 
 
331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.52 
 
 
330 aa  302  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.95 
 
 
314 aa  301  8.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.57 
 
 
337 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.43 
 
 
323 aa  301  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1642  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.58 
 
 
323 aa  301  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.82 
 
 
318 aa  300  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.87 
 
 
314 aa  300  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
311 aa  299  3e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
312 aa  300  3e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000644395 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
316 aa  298  6e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.45 
 
 
314 aa  298  9e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.39 
 
 
313 aa  298  9e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.89 
 
 
316 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.82 
 
 
331 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.147095  normal  0.740679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.89 
 
 
316 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4145  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.44 
 
 
317 aa  297  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>