More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1561 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  100 
 
 		 126 aa  257  5.0000000000000005e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  64.17 
 
 		 154 aa  170  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  63.41 
 
 		 123 aa  170  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  64.23 
 
 		 123 aa  168  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  62.6 
 
 		 123 aa  167  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  60.66 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  60.48 
 
 		 125 aa  161  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  59.83 
 
 		 120 aa  159  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  58.68 
 
 		 124 aa  158  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  64.35 
 
 		 126 aa  159  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  59.35 
 
 		 125 aa  157  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  58.82 
 
 		 120 aa  156  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  56.35 
 
 		 125 aa  156  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  57.5 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  55.56 
 
 		 125 aa  154  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  59.17 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  57.5 
 
 		 124 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  57.94 
 
 		 143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  57.5 
 
 		 124 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  56 
 
 		 126 aa  153  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  57.14 
 
 		 137 aa  152  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  60.18 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  58.12 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  54.47 
 
 		 124 aa  150  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  57.39 
 
 		 131 aa  150  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  57.38 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  57.38 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  54.1 
 
 		 124 aa  150  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  61.06 
 
 		 139 aa  150  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  57.85 
 
 		 123 aa  150  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  59.13 
 
 		 117 aa  150  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  58.54 
 
 		 123 aa  149  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  59.82 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  58.2 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  57.26 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  59.13 
 
 		 125 aa  149  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  57.98 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  64.23 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  63.79 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  57.14 
 
 		 130 aa  147  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  58.62 
 
 		 120 aa  146  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  55.74 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  57.63 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  61.47 
 
 		 120 aa  144  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  56.52 
 
 		 122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  55.46 
 
 		 122 aa  143  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  55.17 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  55.17 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  57.76 
 
 		 123 aa  141  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  58.04 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  49.59 
 
 		 123 aa  141  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  58.33 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  50.41 
 
 		 123 aa  131  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  60.55 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  50.4 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  56.67 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  58.72 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  55.83 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  55.83 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  54.13 
 
 		 123 aa  120  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  44.35 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  44.35 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  40.8 
 
 		 121 aa  117  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  40.8 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  56.31 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  38.46 
 
 		 121 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  43.75 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  47.52 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  51.52 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  45.45 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  49.48 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  49.48 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  47.57 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  46.53 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  48.45 
 
 		 140 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  47.42 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  46.39 
 
 		 170 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  46.39 
 
 		 170 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  46.39 
 
 		 170 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  44.12 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  39.22 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  41.9 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  47 
 
 		 162 aa  94.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  41 
 
 		 140 aa  94  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  44.55 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  44.55 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  44.55 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  44.55 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  44.55 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  44.55 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  43.56 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  43.56 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  43.56 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  43.56 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  43.56 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  43.56 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  43.56 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  43.56 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  43.56 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>