More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1516 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 720 aa  1400    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.06 
 
 		 819 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.06 
 
 		 819 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.38 
 
 		 683 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.83 
 
 		 842 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.55 
 
 		 818 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.61 
 
 		 842 aa  503  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.57 
 
 		 718 aa  501  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.66 
 
 		 786 aa  501  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.71 
 
 		 827 aa  500  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.68 
 
 		 817 aa  496  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.43 
 
 		 689 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.02 
 
 		 685 aa  491  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.89 
 
 		 862 aa  489  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.61 
 
 		 740 aa  486  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  40.86 
 
 		 818 aa  488  1e-136  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.77 
 
 		 827 aa  488  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.39 
 
 		 818 aa  483  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.18 
 
 		 818 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.52 
 
 		 818 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.75 
 
 		 815 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.03 
 
 		 688 aa  476  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.74 
 
 		 706 aa  473  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.12 
 
 		 832 aa  475  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.94 
 
 		 702 aa  472  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0646  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.11 
 
 		 733 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.52 
 
 		 765 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.49 
 
 		 704 aa  472  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.71 
 
 		 681 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09240  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.37 
 
 		 722 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0945523  normal  0.830238 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.78 
 
 		 706 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1279  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.47 
 
 		 733 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.36 
 
 		 767 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8025  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.32 
 
 		 746 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.68 
 
 		 822 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.15 
 
 		 818 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.97 
 
 		 686 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2785  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.7 
 
 		 725 aa  464  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.423247  normal  0.0848754 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.04 
 
 		 815 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.31 
 
 		 682 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.39 
 
 		 772 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.46 
 
 		 703 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.56 
 
 		 763 aa  459  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.6 
 
 		 772 aa  458  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.4 
 
 		 779 aa  457  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.39 
 
 		 812 aa  458  1e-127  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.78 
 
 		 691 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  39.91 
 
 		 700 aa  458  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.51 
 
 		 778 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.27 
 
 		 714 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.84 
 
 		 846 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.94 
 
 		 779 aa  456  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.18 
 
 		 712 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1169  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.01 
 
 		 733 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182311  hitchhiker  0.00000886556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.25 
 
 		 822 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.56 
 
 		 846 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.46 
 
 		 689 aa  449  1e-125  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.83 
 
 		 694 aa  452  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.63 
 
 		 717 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.97 
 
 		 690 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3438  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.2 
 
 		 736 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.936124  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.51 
 
 		 846 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5977  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.22 
 
 		 733 aa  448  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.67 
 
 		 707 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.34 
 
 		 776 aa  444  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.36 
 
 		 829 aa  445  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.53 
 
 		 685 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.15 
 
 		 701 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1984  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.84 
 
 		 690 aa  445  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.79 
 
 		 681 aa  445  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.61 
 
 		 741 aa  444  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1162  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.57 
 
 		 678 aa  442  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000110827  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.52 
 
 		 719 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.26 
 
 		 752 aa  441  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.66 
 
 		 695 aa  439  1e-121  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1967  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.48 
 
 		 682 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.23 
 
 		 696 aa  436  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.57 
 
 		 700 aa  435  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.25 
 
 		 904 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8000  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.85 
 
 		 723 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552876  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2477  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.44 
 
 		 702 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415356  normal  0.385274 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0198  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.76 
 
 		 691 aa  433  1e-120  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1874  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.04 
 
 		 760 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00557261  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0793  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.5 
 
 		 682 aa  431  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.34 
 
 		 787 aa  429  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.58 
 
 		 671 aa  430  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.86 
 
 		 773 aa  429  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.15 
 
 		 686 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.63 
 
 		 747 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.72 
 
 		 692 aa  432  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.99 
 
 		 698 aa  428  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.26 
 
 		 728 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1286  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.63 
 
 		 686 aa  428  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.86 
 
 		 772 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1311  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.63 
 
 		 686 aa  428  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.53 
 
 		 697 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.54 
 
 		 672 aa  428  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.49 
 
 		 703 aa  425  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00158  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.93 
 
 		 690 aa  423  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.85 
 
 		 676 aa  423  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>