More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1507 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1507  SMC domain protein  100 
 
 		 1115 aa  2061    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.44218  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  24.42 
 
 		 1185 aa  277  9e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  27.97 
 
 		 1167 aa  242  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  45.28 
 
 		 1194 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  46.82 
 
 		 1203 aa  192  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  47.17 
 
 		 1188 aa  191  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  47.32 
 
 		 1214 aa  191  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  45.28 
 
 		 1194 aa  189  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  45.28 
 
 		 1217 aa  188  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  45.28 
 
 		 1191 aa  189  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  45.24 
 
 		 1218 aa  187  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  45.24 
 
 		 1234 aa  187  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  44.76 
 
 		 1199 aa  187  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  44.88 
 
 		 1205 aa  187  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  44.29 
 
 		 1198 aa  185  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  44.29 
 
 		 1198 aa  186  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  44.81 
 
 		 1188 aa  185  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  44.34 
 
 		 1227 aa  184  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  43.81 
 
 		 1194 aa  184  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  44.34 
 
 		 1186 aa  184  9.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  39.37 
 
 		 1179 aa  182  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  42.41 
 
 		 1222 aa  183  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  44.34 
 
 		 1188 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  43.87 
 
 		 1194 aa  181  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  42.92 
 
 		 1181 aa  180  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  42.93 
 
 		 1225 aa  180  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  42.41 
 
 		 1195 aa  180  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  35.41 
 
 		 1190 aa  179  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  41.5 
 
 		 1263 aa  179  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  42.11 
 
 		 1224 aa  178  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  36.84 
 
 		 1190 aa  178  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  42.93 
 
 		 1213 aa  177  9e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  24.82 
 
 		 1175 aa  177  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  41.05 
 
 		 1081 aa  176  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  28.31 
 
 		 1191 aa  174  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  29.97 
 
 		 1184 aa  173  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  44.78 
 
 		 1172 aa  172  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  39.21 
 
 		 1174 aa  171  8e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  42.33 
 
 		 1185 aa  169  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  39.42 
 
 		 1301 aa  167  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  38.13 
 
 		 1191 aa  167  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  41.8 
 
 		 1185 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  27.68 
 
 		 1187 aa  166  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  37.93 
 
 		 1185 aa  165  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  34.32 
 
 		 1196 aa  164  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  37.01 
 
 		 980 aa  163  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  31.88 
 
 		 1198 aa  163  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  37.6 
 
 		 1187 aa  162  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  38.57 
 
 		 1162 aa  161  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  39.15 
 
 		 1181 aa  161  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  38.05 
 
 		 1162 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  37.08 
 
 		 1162 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  38.05 
 
 		 1162 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  34.17 
 
 		 1162 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  38.05 
 
 		 1162 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  38.05 
 
 		 1188 aa  160  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  38.05 
 
 		 1188 aa  160  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  37.56 
 
 		 1189 aa  159  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  40.21 
 
 		 1172 aa  160  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  33.44 
 
 		 1162 aa  160  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  38.66 
 
 		 1163 aa  159  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  30.91 
 
 		 1307 aa  159  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  37.31 
 
 		 1187 aa  159  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  41.05 
 
 		 1190 aa  158  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  39.22 
 
 		 1255 aa  157  7e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  36.17 
 
 		 1168 aa  157  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  32.06 
 
 		 1185 aa  158  7e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  37.2 
 
 		 1169 aa  157  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  43.72 
 
 		 1187 aa  157  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  41.09 
 
 		 1186 aa  157  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0467  SMC domain-containing protein  39.56 
 
 		 1280 aa  157  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  37.96 
 
 		 1162 aa  156  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  38.25 
 
 		 1162 aa  156  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  37.98 
 
 		 1189 aa  155  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  37.98 
 
 		 1189 aa  155  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  37.98 
 
 		 1189 aa  155  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  37.02 
 
 		 1189 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  37.02 
 
 		 1189 aa  154  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  37.02 
 
 		 1189 aa  154  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  37.02 
 
 		 1189 aa  154  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  37.02 
 
 		 1189 aa  154  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  37.02 
 
 		 1189 aa  154  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  37.5 
 
 		 1189 aa  154  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  33.09 
 
 		 1170 aa  154  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  37.5 
 
 		 1189 aa  154  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  37.01 
 
 		 1174 aa  153  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  28.26 
 
 		 1177 aa  153  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  27.43 
 
 		 1176 aa  152  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  38.39 
 
 		 1204 aa  152  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf735  chromosome segregation ATPase Smc  38.71 
 
 		 978 aa  151  7e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  36.53 
 
 		 1177 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  30.08 
 
 		 1178 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  35.42 
 
 		 1170 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  36.32 
 
 		 1186 aa  150  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 		 1179 aa  150  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0349  SMC protein-like  38.56 
 
 		 1318 aa  149  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  35.53 
 
 		 1179 aa  148  6e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1177 aa  147  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  32.53 
 
 		 1178 aa  147  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  33.07 
 
 		 1168 aa  147  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>