More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1447 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  100 
 
 		 147 aa  293  6e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  45.19 
 
 		 289 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  46.04 
 
 		 144 aa  102  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  42.48 
 
 		 321 aa  97.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  40.88 
 
 		 288 aa  97.1  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  41.48 
 
 		 288 aa  94.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  44.53 
 
 		 291 aa  93.6  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  39.57 
 
 		 287 aa  91.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  44.44 
 
 		 292 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  44.44 
 
 		 292 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  44.44 
 
 		 292 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  42.96 
 
 		 291 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  39.86 
 
 		 315 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  44.06 
 
 		 146 aa  90.5  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  41.61 
 
 		 288 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 296 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  41.43 
 
 		 293 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  40 
 
 		 159 aa  88.6  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  40.88 
 
 		 276 aa  88.2  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  40.88 
 
 		 293 aa  88.2  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  41.35 
 
 		 295 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  36.43 
 
 		 289 aa  87  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  42.11 
 
 		 305 aa  86.3  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 289 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  44.44 
 
 		 192 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  37.78 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  41.91 
 
 		 303 aa  85.1  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  41.33 
 
 		 308 aa  85.1  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 		 155 aa  84  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  42.45 
 
 		 303 aa  84  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  41.18 
 
 		 298 aa  84  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  39.1 
 
 		 294 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  40.29 
 
 		 343 aa  84  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  39.1 
 
 		 294 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  39.1 
 
 		 294 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  41.13 
 
 		 155 aa  83.6  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  39.13 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  40 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.77 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4449  hypothetical protein  41.13 
 
 		 311 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  40.3 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  41.79 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  40.15 
 
 		 294 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  41.18 
 
 		 287 aa  81.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  42.47 
 
 		 339 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  39.85 
 
 		 296 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  40.3 
 
 		 285 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 		 296 aa  80.9  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  36.76 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  40 
 
 		 347 aa  80.1  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  42.42 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  38.85 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  36.03 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  36.17 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  36.96 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  36.96 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  36.84 
 
 		 313 aa  78.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  38.97 
 
 		 282 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  39.72 
 
 		 301 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  40.74 
 
 		 302 aa  77.8  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  40.97 
 
 		 323 aa  77.8  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 381 aa  77.4  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  37.67 
 
 		 308 aa  77.8  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  36.96 
 
 		 294 aa  77.4  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  37.68 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  36.43 
 
 		 302 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  35.07 
 
 		 295 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2802  UspA domain protein  45 
 
 		 174 aa  77  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  35.07 
 
 		 295 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  35.07 
 
 		 295 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  45.45 
 
 		 284 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  32.35 
 
 		 341 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 296 aa  76.6  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  41.67 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  36.05 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  31.62 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  36.43 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  39.42 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  36.55 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  31.62 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  35.77 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  38.89 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  37.96 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  38.57 
 
 		 310 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  35.1 
 
 		 317 aa  75.1  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  33.57 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  37.59 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  35.86 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  40.14 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  40.14 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  35.77 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>