More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1435 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 		 199 aa  396  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  45.36 
 
 		 211 aa  184  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.88 
 
 		 226 aa  164  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  44.1 
 
 		 202 aa  160  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0723  ThiJ/PfpI domain protein  41.33 
 
 		 199 aa  157  9e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.75 
 
 		 227 aa  157  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3669  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.81 
 
 		 241 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2139  DJ-1/PfpI family protein  38.14 
 
 		 198 aa  137  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.5 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4082  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.11 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08527  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14240)  37.32 
 
 		 284 aa  128  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0997255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  37.82 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.52 
 
 		 193 aa  114  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.59 
 
 		 234 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.23 
 
 		 234 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  34.24 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  34.24 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  36.02 
 
 		 231 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  39.36 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.05 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  37.77 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  37.3 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  37.04 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  37.44 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  37 
 
 		 232 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  37 
 
 		 232 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  37 
 
 		 232 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  37 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  37 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  37 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  37.82 
 
 		 323 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  37 
 
 		 691 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.39 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  41.33 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  36.98 
 
 		 279 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  38.71 
 
 		 243 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40 
 
 		 262 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  38.97 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  35.11 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.36 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  36.36 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.36 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.85 
 
 		 199 aa  104  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  35.5 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  38.58 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.5 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  32.16 
 
 		 312 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  35.98 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  38.15 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 324 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06760  conserved hypothetical protein  30.73 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130038  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  37.24 
 
 		 239 aa  102  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 357 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  36.07 
 
 		 229 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  36.87 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  39.36 
 
 		 320 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  34.78 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.31 
 
 		 276 aa  101  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.57 
 
 		 233 aa  101  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 315 aa  101  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  35.29 
 
 		 233 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  30.96 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  31.05 
 
 		 329 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.76 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.01 
 
 		 338 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  31 
 
 		 319 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  28.71 
 
 		 349 aa  99.8  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.51 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.29 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  34.16 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  34.16 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  35.57 
 
 		 328 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  39.04 
 
 		 245 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  36.02 
 
 		 330 aa  99  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.04 
 
 		 245 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  31.02 
 
 		 358 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.59 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  31.75 
 
 		 196 aa  99  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  31.72 
 
 		 254 aa  98.6  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 198 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.04 
 
 		 245 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  37.1 
 
 		 322 aa  97.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 319 aa  97.8  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 328 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 317 aa  97.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 348 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  35.47 
 
 		 310 aa  97.1  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.66 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  33.16 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  30.2 
 
 		 319 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  34.76 
 
 		 239 aa  96.3  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  31.86 
 
 		 321 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  31.34 
 
 		 319 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 322 aa  95.9  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 338 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  35.5 
 
 		 234 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.5 
 
 		 234 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>