63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1338 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  100 
 
 
230 aa  460  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  39.44 
 
 
201 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
224 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  36.46 
 
 
211 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  38.66 
 
 
206 aa  99.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  39.25 
 
 
212 aa  95.5  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  33.89 
 
 
193 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  34.29 
 
 
191 aa  86.3  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  32 
 
 
225 aa  78.2  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  37.13 
 
 
198 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  32.23 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  35.2 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  31.75 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  30.53 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  33.54 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 
243 aa  72  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  32.99 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05590  hypothetical protein  38.36 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604639  normal  0.83451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  29.44 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  28.8 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  33.55 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  32.57 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  33.78 
 
 
192 aa  64.7  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
200 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  35.09 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
187 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
186 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
183 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  28.48 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  45.45 
 
 
187 aa  52.8  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 
182 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  26.62 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  29.79 
 
 
472 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0006  regulatory protein, ArsR  39.66 
 
 
98 aa  45.4  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
95 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
95 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0221  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
99 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000466476  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
95 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
95 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
95 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
95 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0200  transcriptional regulator, ArsR family  35.59 
 
 
99 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0013228  hitchhiker  4.7495300000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  28.89 
 
 
95 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  28.89 
 
 
95 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5558  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
99 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249021 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  40 
 
 
95 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0244  transcriptional regulator, ArsR family  35.59 
 
 
99 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10115e-49 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
95 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
95 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  34.94 
 
 
230 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3065  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
99 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534243  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3305  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
99 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1504  transcriptional regulator, TrmB  39.29 
 
 
110 aa  42.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2815  ArsR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
169 aa  42.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.897524  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
107 aa  42  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2260  transcriptional regulator, ArsR family  25.5 
 
 
183 aa  41.6  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.1059  normal  0.463419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>