More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1305 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  100 
 
 		 235 aa  454  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3472  thioredoxin  44.91 
 
 		 246 aa  161  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.0143649 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  46.55 
 
 		 315 aa  158  7e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  40.98 
 
 		 282 aa  155  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  36.62 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  37.72 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  37.72 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  33.22 
 
 		 330 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  35.48 
 
 		 310 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  43.58 
 
 		 293 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  37.37 
 
 		 282 aa  148  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  38.03 
 
 		 282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  37.85 
 
 		 293 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  35.74 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  38.08 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  37.19 
 
 		 282 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  35.71 
 
 		 281 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  35.21 
 
 		 324 aa  145  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  33.33 
 
 		 302 aa  144  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  37.72 
 
 		 282 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  37.72 
 
 		 282 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  37.05 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  31.32 
 
 		 326 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  35.19 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  38.29 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  34.51 
 
 		 329 aa  142  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  37.37 
 
 		 282 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  35 
 
 		 281 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  38.43 
 
 		 301 aa  141  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  38.43 
 
 		 282 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  38.43 
 
 		 282 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  35.69 
 
 		 317 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  34.15 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  37.72 
 
 		 282 aa  138  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  32.75 
 
 		 334 aa  138  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  35.11 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  38.43 
 
 		 918 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  36.19 
 
 		 299 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  42.29 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  35.71 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  41.33 
 
 		 280 aa  135  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  32.17 
 
 		 324 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  37.01 
 
 		 282 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  40.4 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  31.8 
 
 		 302 aa  134  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  42.54 
 
 		 300 aa  134  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  36.62 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  31.12 
 
 		 324 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  42.38 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  42.38 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  35.06 
 
 		 337 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  35.69 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  34.56 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  35.69 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  48.95 
 
 		 286 aa  129  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  36.06 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  34.97 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  48.95 
 
 		 286 aa  128  9.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  34.26 
 
 		 304 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  41.62 
 
 		 302 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  57.28 
 
 		 303 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  37.85 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  33.91 
 
 		 304 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  34.43 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  38.31 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  34.14 
 
 		 287 aa  125  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  37.45 
 
 		 331 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  32.98 
 
 		 289 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  35.5 
 
 		 305 aa  124  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  32.98 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  32.65 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  33.21 
 
 		 287 aa  123  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  35.36 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  53.85 
 
 		 329 aa  123  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  27.6 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  31.9 
 
 		 286 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  32.28 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  48.41 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  31.21 
 
 		 287 aa  121  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  40.59 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  41.52 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  34.86 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  41.21 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  35.27 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  36.69 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  32.7 
 
 		 268 aa  119  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  33.01 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  33.92 
 
 		 289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  30.39 
 
 		 302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  33.71 
 
 		 313 aa  118  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  33.09 
 
 		 285 aa  118  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  33.9 
 
 		 338 aa  118  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  52.53 
 
 		 110 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  29.79 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  30.34 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  29.64 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  30.07 
 
 		 302 aa  116  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  34.04 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  29.47 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  28.52 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>