60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1299 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1299  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 239 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.788342  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0051  ApbE family lipoprotein  35.47 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.252526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6589  ApbE family lipoprotein  37.24 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3726  ApbE family lipoprotein  33.19 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6144  ApbE family lipoprotein  33.82 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.592047  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3924  ApbE-like lipoprotein  34.22 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  32.49 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1238  hypothetical protein  36.36 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.503143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0382  ApbE family lipoprotein  39.41 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.529182  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0491  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  23.53 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1501  ApbE family lipoprotein  35.71 
 
 		 509 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  30.56 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1128  hypothetical protein  35.45 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110664 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0233  ApbE-like lipoprotein  37.64 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3618  ApbE family lipoprotein  29.52 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128321  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  33.87 
 
 		 336 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.7 
 
 		 341 aa  52  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  29.94 
 
 		 353 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0280  nosX protein  26.16 
 
 		 330 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  32.41 
 
 		 345 aa  49.7  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  25.17 
 
 		 344 aa  49.7  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  34.88 
 
 		 351 aa  49.7  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  36.24 
 
 		 304 aa  48.9  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.25 
 
 		 320 aa  48.5  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  31.5 
 
 		 347 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  37.12 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  30.86 
 
 		 352 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  30.8 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  29.21 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  35.56 
 
 		 331 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0038  ApbE family lipoprotein  29.2 
 
 		 302 aa  46.6  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  31.01 
 
 		 342 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 305 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  29.31 
 
 		 344 aa  46.2  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  24.92 
 
 		 343 aa  45.8  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  32.06 
 
 		 345 aa  45.8  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  28.32 
 
 		 344 aa  45.4  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  25.65 
 
 		 310 aa  45.4  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.83 
 
 		 363 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.43 
 
 		 357 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  30 
 
 		 298 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  33.76 
 
 		 350 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.26 
 
 		 336 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.17 
 
 		 348 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0708  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  29.27 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.314159  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  29.71 
 
 		 360 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  23.08 
 
 		 335 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2415  ApbE family lipoprotein  39.42 
 
 		 325 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.410887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  29.32 
 
 		 304 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  29.63 
 
 		 326 aa  42.7  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  27.52 
 
 		 336 aa  42.4  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  33.09 
 
 		 336 aa  42.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1886  ApbE family lipoprotein  31.01 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00789462  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  28.43 
 
 		 358 aa  42  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.38 
 
 		 349 aa  42  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1391  ApbE family lipoprotein  30.71 
 
 		 347 aa  42  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.34 
 
 		 348 aa  42  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.93 
 
 		 313 aa  42  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  26.46 
 
 		 352 aa  42  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  32.45 
 
 		 327 aa  41.6  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>