125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1287 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1287  GPR1/FUN34/yaaH family protein  100 
 
 
255 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00383069  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22570  predicted membrane protein  59.34 
 
 
197 aa  205  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.216454  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4506  GPR1/FUN34/yaaH family protein  51.58 
 
 
202 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2192  GPR1/FUN34/yaaH family protein  46.67 
 
 
201 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1117  GPR1/FUN34/yaaH family protein  52.15 
 
 
207 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0710546  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1305  GPR1/FUN34/yaaH family protein  46.6 
 
 
200 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0029  GPR1/FUN34/yaaH family protein  47.89 
 
 
223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0541  hypothetical protein  42.7 
 
 
190 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.49636  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0492  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.7 
 
 
197 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0724  GPR1/FUN34/yaaH  40.22 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  41.67 
 
 
183 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0580  hypothetical protein  41.3 
 
 
190 aa  129  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  40.11 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.954499  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0065  GPR1/FUN34/yaaH family protein  40.43 
 
 
196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5595  GPR1/FUN34/yaaH family protein  42.93 
 
 
201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626541  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.56 
 
 
214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444258  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31420  predicted protein  42.27 
 
 
258 aa  126  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.450745  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3660  hypothetical protein  40.32 
 
 
191 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.444217  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3855  hypothetical protein  39.78 
 
 
191 aa  125  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.770098  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1480  permease  41.34 
 
 
189 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1861  hypothetical protein  42.93 
 
 
211 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1067  GPR1/FUN34/yaaH family protein  43.39 
 
 
206 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00312411  normal  0.445935 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3467  hypothetical protein  41.44 
 
 
203 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0798  hypothetical protein  41.44 
 
 
203 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000907373  normal  0.0776345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3595  hypothetical protein  41.44 
 
 
203 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0906121  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02960  conserved hypothetical protein  40.74 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.392793  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83722  Accumulation of DYads  43.75 
 
 
274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2982  GPR1/FUN34/yaaH family protein  42.78 
 
 
186 aa  118  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119024  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0666  GPR1/FUN34/yaaH family protein  44.2 
 
 
186 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0435275  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3478  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.57 
 
 
195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1352  GPR1/FUN34/yaaH family protein  45.3 
 
 
186 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000041614  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0577  hypothetical protein  37.57 
 
 
188 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.825629  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0009  hypothetical protein  37.02 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207704  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0009  hypothetical protein  37.02 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436891  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0009  hypothetical protein  37.02 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.350527  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0009  hypothetical protein  37.02 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.396236  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00010  conserved inner membrane protein associated with acetate transport  37.57 
 
 
188 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3586  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.57 
 
 
188 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0011  hypothetical protein  37.57 
 
 
188 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.708242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0010  hypothetical protein  37.57 
 
 
188 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3645  hypothetical protein  37.57 
 
 
188 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0009  hypothetical protein  37.02 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0011  hypothetical protein  37.57 
 
 
188 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00010  hypothetical protein  37.57 
 
 
188 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0552  hypothetical protein  37.24 
 
 
194 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.85069e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0691  hypothetical protein  37.99 
 
 
199 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.003925  hitchhiker  0.00210263 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0009  hypothetical protein  37.57 
 
 
188 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1224  transcriptional regulator  35 
 
 
200 aa  112  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0263  GPR1/FUN34/yaaH family protein  35.57 
 
 
199 aa  112  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1126  GPR1/FUN34/yaaH  37.43 
 
 
203 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05226  Acetate permeasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2K4]  39.2 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.719404  normal  0.707615 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0634  GPR1/FUN34/yaaH  38.83 
 
 
198 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0870411  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0010  hypothetical protein  37.02 
 
 
188 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0237  Gpr1/Fun34/YaaH family protein  36.07 
 
 
183 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2076  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.25 
 
 
183 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0364  GPR1/FUN34/yaaH family protein  41.18 
 
 
186 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1124  GPR1/FUN34/yaaH family protein  36.41 
 
 
196 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.546055 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0605  GPR1/FUN34/yaaH family protein  34.01 
 
 
197 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1253  GPR1/FUN34/yaaH family protein  41.67 
 
 
194 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284277  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0755  GPR1/FUN34/yaaH  40.32 
 
 
190 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.830173  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1357  GPR1/FUN34/yaaH family protein  36.04 
 
 
194 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.55658  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2772  GPR1/FUN34/yaaH family protein  35.89 
 
 
213 aa  105  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.713345  normal  0.632048 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01082  hypothetical protein  36.87 
 
 
197 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0890  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.22 
 
 
199 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.400956  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0904  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.02 
 
 
188 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0524  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.57 
 
 
196 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.153386 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01839  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.009571  normal  0.645979 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03640  membrane protein, putative  34.95 
 
 
283 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0291661  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004328  hypothetical protein  35.75 
 
 
196 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0999  hypothetical protein  35.91 
 
 
203 aa  99.8  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1348  GPR1/FUN34/yaaH family protein  34.78 
 
 
197 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00408603 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1050  GPR1/FUN34/yaaH family protein  34.81 
 
 
203 aa  98.2  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1327  GPR1/FUN34/yaaH family protein  34.03 
 
 
197 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.39924  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2835  GPR1/FUN34/yaaH family protein  36.65 
 
 
193 aa  96.7  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.244228  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0299  hypothetical protein  35.2 
 
 
197 aa  96.3  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3180  GPR1/FUN34/yaaH family protein  35 
 
 
189 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3588  gpr1/fun34/yaaH family protein  35 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3002  GPR1/FUN34/yaaH family protein  35 
 
 
189 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal  0.240175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3083  GPR1/FUN34/yaaH family protein  35 
 
 
189 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0605595  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3630  GPR1/FUN34/yaaH family protein  32.78 
 
 
209 aa  94  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35799  predicted protein  37.65 
 
 
272 aa  94  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0356533  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1075  GPR1/FUN34/yaaH family protein  34.44 
 
 
187 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1108  GPR1/FUN34/yaaH family protein  34.44 
 
 
187 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00215615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  33.89 
 
 
187 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.264314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2423  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.36 
 
 
194 aa  89.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542283  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1320  membrane protein  33.92 
 
 
183 aa  88.6  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0212  GPR1/FUN34/yaaH family protein  40.24 
 
 
209 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0761648 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0228  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.05 
 
 
209 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1410  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33707  predicted protein  35.36 
 
 
274 aa  85.1  9e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.373247  hitchhiker  0.000185367 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3336  hypothetical protein  31.35 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000909805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3301  GPR1/FUN34/yaaH family protein  31.35 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.83805e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3597  hypothetical protein  31.35 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000113907  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3560  hypothetical protein  31.35 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000016345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3650  hypothetical protein  31.35 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1667  hypothetical protein  31.35 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  hitchhiker  6.45658e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3556  hypothetical protein  31.35 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000310297  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0695  gpr1/fun34/YaaH family protein  33.89 
 
 
200 aa  84  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3551  hypothetical protein  31.35 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8351e-43 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7849  predicted protein  34.05 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.161215 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>