More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1219 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  100 
 
 
250 aa  500  1e-141  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  53.23 
 
 
247 aa  277  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  52.57 
 
 
253 aa  277  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  54.07 
 
 
249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  56.8 
 
 
252 aa  272  5.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  51.61 
 
 
247 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  54.03 
 
 
249 aa  267  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  54.37 
 
 
251 aa  267  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17500  conserved hypothetical protein TIGR01033  55.42 
 
 
252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2629  hypothetical protein  53.6 
 
 
251 aa  264  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  54.98 
 
 
251 aa  263  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2108  protein of unknown function DUF28  55.87 
 
 
249 aa  262  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00811013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  50.4 
 
 
247 aa  261  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  53.01 
 
 
250 aa  260  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  49.8 
 
 
251 aa  261  1e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  50.4 
 
 
247 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  55.28 
 
 
249 aa  259  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3057  protein of unknown function DUF28  52.82 
 
 
253 aa  259  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2066  hypothetical protein  54.22 
 
 
250 aa  260  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  53.41 
 
 
249 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  48.79 
 
 
247 aa  259  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6116  hypothetical protein  54.62 
 
 
250 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  0.165467 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  52.19 
 
 
253 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2251  hypothetical protein  52.61 
 
 
250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.06842  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2290  hypothetical protein  52.61 
 
 
250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  54.22 
 
 
248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2298  hypothetical protein  52.61 
 
 
250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  53.11 
 
 
250 aa  257  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1368  hypothetical protein  53.23 
 
 
251 aa  257  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  53.11 
 
 
250 aa  257  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  48.39 
 
 
247 aa  257  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1371  protein of unknown function DUF28  53.01 
 
 
252 aa  256  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.82714  normal  0.0256064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  50.6 
 
 
250 aa  256  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  52.85 
 
 
249 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5147  hypothetical protein  53.63 
 
 
251 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000302619  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2351  protein of unknown function DUF28  52 
 
 
251 aa  255  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  51.39 
 
 
253 aa  255  5e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3828  hypothetical protein  52.38 
 
 
251 aa  254  6e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12622  hypothetical protein  53.66 
 
 
251 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0825  protein of unknown function DUF28  53.01 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  0.0381393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  48.39 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15350  conserved hypothetical protein TIGR01033  51.6 
 
 
251 aa  251  5.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144785  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  51.98 
 
 
252 aa  251  5.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  51.45 
 
 
248 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3398  protein of unknown function DUF28  50.2 
 
 
255 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438869  decreased coverage  0.000000218577 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  51.61 
 
 
247 aa  249  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  52.02 
 
 
248 aa  247  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  48.39 
 
 
249 aa  246  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  49 
 
 
246 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  52.02 
 
 
247 aa  246  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  49.8 
 
 
250 aa  246  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  49.2 
 
 
250 aa  246  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13930  conserved hypothetical protein TIGR01033  51.43 
 
 
254 aa  246  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0487372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2110  protein of unknown function DUF28  52.61 
 
 
251 aa  245  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190247  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  55.65 
 
 
250 aa  244  9e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  48.19 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2383  hypothetical protein  48.64 
 
 
259 aa  243  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  50 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  50.2 
 
 
248 aa  241  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  48.59 
 
 
250 aa  241  7e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  47.39 
 
 
250 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  48.18 
 
 
248 aa  241  9e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  47.54 
 
 
243 aa  240  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  47.35 
 
 
249 aa  241  1e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  52.19 
 
 
252 aa  240  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0661  hypothetical protein  49.6 
 
 
248 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135239  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  48.19 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1932  protein of unknown function DUF28  51.19 
 
 
251 aa  239  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  46.77 
 
 
249 aa  239  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  46.34 
 
 
246 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  46.59 
 
 
250 aa  238  9e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  47.39 
 
 
246 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1704  hypothetical protein  51.2 
 
 
252 aa  237  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609953  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  46.38 
 
 
248 aa  237  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2299  protein of unknown function DUF28  51.19 
 
 
251 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  49 
 
 
249 aa  237  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  44.4 
 
 
250 aa  236  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  46.59 
 
 
250 aa  236  3e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  48.99 
 
 
245 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  48.36 
 
 
247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  52.61 
 
 
249 aa  235  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0839  DNA-binding regulatory protein, YebC/PmpR family  51 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3629  hypothetical protein  48.59 
 
 
252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000422691  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  48.19 
 
 
248 aa  232  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  47.39 
 
 
249 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  48.98 
 
 
248 aa  230  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1228  hypothetical protein  48.79 
 
 
252 aa  230  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150429  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  48.95 
 
 
239 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  49.58 
 
 
239 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  47.18 
 
 
246 aa  231  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  47.76 
 
 
248 aa  230  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0925  protein of unknown function DUF28  47.58 
 
 
250 aa  229  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.488101  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  49 
 
 
248 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0025  hypothetical protein  46.72 
 
 
243 aa  229  4e-59  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  47.98 
 
 
248 aa  228  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  48.59 
 
 
248 aa  228  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  47.98 
 
 
248 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  44.81 
 
 
246 aa  228  8e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0807  hypothetical protein  48.21 
 
 
251 aa  228  9e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  48.77 
 
 
248 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>