263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1196 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1196  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  100 
 
 
156 aa  308  1e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0922394  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  56.64 
 
 
148 aa  164  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1263  ribose-5-phosphate isomerase  54.55 
 
 
152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1182  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  52.82 
 
 
145 aa  161  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  53.42 
 
 
149 aa  157  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2701  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  52.52 
 
 
143 aa  156  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  0.215374 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  54.17 
 
 
322 aa  154  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4198  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  55.8 
 
 
145 aa  154  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.335941  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  54.17 
 
 
149 aa  153  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  54.93 
 
 
148 aa  152  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  53.57 
 
 
143 aa  150  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2392  ribose-5-phosphate isomerase  53.15 
 
 
181 aa  149  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.73759  normal  0.0712618 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1737  ribose 5-phosphate isomerase B  51.77 
 
 
143 aa  149  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1664  ribose 5-phosphate isomerase B  51.77 
 
 
143 aa  149  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  47.22 
 
 
149 aa  148  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  50.35 
 
 
149 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  50 
 
 
148 aa  147  5e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  51.37 
 
 
149 aa  147  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  51.37 
 
 
149 aa  147  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0790  ribose 5-phosphate isomerase B  50.7 
 
 
145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  45.45 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1026  ribose 5-phosphate isomerase B  52.41 
 
 
148 aa  145  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0043  ribose 5-phosphate isomerase B  49.28 
 
 
142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0098  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  51.7 
 
 
148 aa  144  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  47.92 
 
 
149 aa  143  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000129497  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2314  ribose-5-phosphate isomerase  46.9 
 
 
149 aa  142  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  51.37 
 
 
149 aa  143  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2620  ribose 5-phosphate isomerase  56.55 
 
 
149 aa  143  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.285539  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  55.56 
 
 
147 aa  141  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2859  ribose-5-phosphate isomerase  43.92 
 
 
162 aa  140  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346833 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1441  ribose 5-phosphate isomerase B  45.45 
 
 
151 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0559  ribose 5-phosphate isomerase B  49.28 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  46.15 
 
 
147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  53.15 
 
 
152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2837  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  53.1 
 
 
147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03962  ribose-5-phosphate isomerase B  48.25 
 
 
149 aa  137  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3901  ribose 5-phosphate isomerase B  48.25 
 
 
149 aa  137  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3936  ribose-5-phosphate isomerase B  48.25 
 
 
149 aa  137  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03435  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  45.32 
 
 
143 aa  137  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0370371  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4556  ribose-5-phosphate isomerase B  48.25 
 
 
149 aa  137  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03922  hypothetical protein  48.25 
 
 
149 aa  137  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  50.7 
 
 
149 aa  137  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811694  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1446  ribose 5-phosphate isomerase B  53.33 
 
 
144 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.396381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2745  ribose-5-phosphate isomerase  52.41 
 
 
147 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2929  ribose 5-phosphate isomerase B  53.47 
 
 
147 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1747  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  51.08 
 
 
145 aa  136  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2734  ribose 5-phosphate isomerase B  51.03 
 
 
147 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2065  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  46.48 
 
 
149 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1236  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  49.3 
 
 
144 aa  135  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2531  ribose 5-phosphate isomerase  52.38 
 
 
155 aa  135  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.9034  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  44.76 
 
 
149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1375  ribose 5-phosphate isomerase  54.79 
 
 
150 aa  134  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00903478 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24510  ribose 5-phosphate isomerase  52.08 
 
 
149 aa  134  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.893298  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3408  ribose 5-phosphate isomerase  52.78 
 
 
155 aa  134  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  50 
 
 
146 aa  134  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5443  ribose 5-phosphate isomerase  50.68 
 
 
159 aa  134  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1747  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  47.92 
 
 
148 aa  134  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0569698  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3889  ribose-5-phosphate isomerase B  50 
 
 
155 aa  133  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.212373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1401  ribose 5-phosphate isomerase  51.39 
 
 
160 aa  131  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7320  ribose/galactose isomerase  50.34 
 
 
169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1864  ribose 5-phosphate isomerase B  51.06 
 
 
149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1322  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  50.72 
 
 
142 aa  130  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2581  ribose-5-phosphate isomerase B  50.34 
 
 
157 aa  130  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
370 aa  130  6e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2120  ribose-5-phosphate isomerase  46.76 
 
 
146 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00298451  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3631  ribose 5-phosphate isomerase B  47.55 
 
 
145 aa  130  7.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2202  ribose-5-phosphate isomerase B  48.97 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1042  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  46.38 
 
 
142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000715199  hitchhiker  0.000018847 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3745  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  48.57 
 
 
142 aa  128  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0446576  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3821  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  46.04 
 
 
146 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0187638  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0481  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  48.25 
 
 
150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00576444 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1880  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  45.83 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1604  ribose-5-phosphate isomerase  47.92 
 
 
148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0025055  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4874  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  46.81 
 
 
143 aa  127  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585109 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0947  ribose 5-phosphate isomerase  49.31 
 
 
150 aa  127  8.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3514  ribose-5-phosphate isomerase B  48.61 
 
 
155 aa  127  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1019  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45.45 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1145  ribose 5-phosphate isomerase  50 
 
 
161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1105  ribose 5-phosphate isomerase  47.92 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0488  ribose-5-phosphate isomerase B  47.97 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.136003  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1042  ribose 5-phosphate isomerase B  43.36 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1815  ribose 5-phosphate isomerase  46.05 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12125  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1791  ribose 5-phosphate isomerase B  46.05 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1332  ribose-5-phosphate isomerase  44.93 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11660  ribose 5-phosphate isomerase  47.33 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0813  ribose 5-phosphate isomerase  46.05 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1104  ribose 5-phosphate isomerase  46.05 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0454  ribose 5-phosphate isomerase B  46.05 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0359  ribose 5-phosphate isomerase B  46.05 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2077  ribose 5-phosphate isomerase  46.05 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4053  ribose-5-phosphate isomerase B  46.94 
 
 
157 aa  124  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0792  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  46.38 
 
 
140 aa  124  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2593  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.66 
 
 
153 aa  124  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1553  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  47.48 
 
 
147 aa  124  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1460  ribose-5-phosphate isomerase  44.9 
 
 
149 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0792  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  48.57 
 
 
150 aa  123  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0447104  normal  0.0700549 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1922  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  43.84 
 
 
153 aa  122  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0852  ribose 5-phosphate isomerase B  45.93 
 
 
150 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00452736  normal  0.320057 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09810  ribose-5-phosphate isomerase B  50 
 
 
157 aa  121  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0167583  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2239  ribose-5-phosphate isomerase  45.32 
 
 
145 aa  121  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>