179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1183 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
387 aa  760    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  36.12 
 
 
817 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0566  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.98 
 
 
674 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297383  normal  0.30294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  32.08 
 
 
771 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1081  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.38 
 
 
370 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.82 
 
 
371 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2389  hypothetical protein  32.05 
 
 
762 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280266  normal  0.917371 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11385  hypothetical protein  36.3 
 
 
715 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1749  hypothetical protein  34.23 
 
 
709 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13421  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1796  hypothetical protein  34.23 
 
 
709 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284537  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1730  hypothetical protein  34.23 
 
 
709 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1968  hypothetical protein  36.36 
 
 
726 aa  125  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4376  hypothetical protein  33.02 
 
 
710 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209188  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  27.17 
 
 
770 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0204  hypothetical protein  35.23 
 
 
711 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  30.99 
 
 
730 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0073  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000480961  normal  0.411412 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.85 
 
 
254 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251146  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.22 
 
 
254 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2029  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.65 
 
 
258 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157166 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.22 
 
 
244 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1368  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.82 
 
 
255 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000273518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.77 
 
 
242 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.21 
 
 
253 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000172262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.09 
 
 
258 aa  60.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00658459  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3110  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  27.14 
 
 
254 aa  60.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  28.36 
 
 
272 aa  60.5  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  33.55 
 
 
267 aa  60.5  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3288  thiF family protein  32.26 
 
 
255 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1898  HesA/MoeB/ThiF family protein  32.72 
 
 
273 aa  60.1  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002691  HesA/MoeB/ThiF family protein  35.34 
 
 
269 aa  60.1  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03292  hypothetical protein  34.48 
 
 
269 aa  60.1  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1623  hypothetical protein  35.61 
 
 
295 aa  59.7  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.240534  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3176  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.12 
 
 
257 aa  59.7  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  33.08 
 
 
275 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3237  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.31 
 
 
255 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0154153  normal  0.0391126 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1178  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.09 
 
 
267 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2453  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  30.57 
 
 
253 aa  57.4  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  33.12 
 
 
268 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  33.08 
 
 
275 aa  57  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  33.12 
 
 
268 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  33.12 
 
 
268 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  33.12 
 
 
268 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.08 
 
 
275 aa  57  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1940  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.12 
 
 
262 aa  57  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.333296 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  33.12 
 
 
268 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  29.86 
 
 
679 aa  56.2  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1525  ThiF family protein  33.08 
 
 
276 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2278  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.28 
 
 
244 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00531511  hitchhiker  0.000000738809 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  32.47 
 
 
989 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2248  HesA/MoeB/ThiF family protein  29.63 
 
 
240 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4414  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.08 
 
 
256 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00164225  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1276  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.47 
 
 
283 aa  55.1  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0911002  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1675  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.33 
 
 
242 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.492542  hitchhiker  0.00106049 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  29.88 
 
 
277 aa  54.3  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3809  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.58 
 
 
268 aa  54.3  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000533838  hitchhiker  0.000000527658 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.76 
 
 
330 aa  53.9  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  32.47 
 
 
268 aa  53.9  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  32.47 
 
 
268 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.47 
 
 
268 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.47 
 
 
268 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3182  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.77 
 
 
277 aa  53.5  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  32.47 
 
 
268 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  32.47 
 
 
268 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  32.47 
 
 
268 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3036  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.22 
 
 
258 aa  53.5  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0902  HesA/MoeB/ThiF family protein  33.59 
 
 
288 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.3 
 
 
272 aa  52.8  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.65 
 
 
242 aa  52.8  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0360  HesA/MoeB/ThiF family protein  33.59 
 
 
288 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00356091  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1062  HesA/MoeB/ThiF family protein  33.59 
 
 
341 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  31.61 
 
 
266 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0946  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.6 
 
 
254 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3072  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.33 
 
 
267 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0660  HesA/MoeB/ThiF family protein  33.59 
 
 
288 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0996044  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2495  HesA/MoeB/ThiF family protein  33.59 
 
 
288 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0905  HesA/MoeB/ThiF family protein  33.59 
 
 
288 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0108  HesA/MoeB/ThiF family protein  33.59 
 
 
288 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00087346  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0735  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.4 
 
 
267 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0923  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.56 
 
 
270 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0515  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.85 
 
 
286 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.59 
 
 
267 aa  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.049758 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.59 
 
 
267 aa  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0318516 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2615  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.34 
 
 
285 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1726  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.82 
 
 
260 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0402438 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1067  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.6 
 
 
267 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.451189  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.34 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2591  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.74 
 
 
285 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1720  molybdopterin and thiamine biosynthesis family protein  32.32 
 
 
272 aa  51.6  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000223945  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5899  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.74 
 
 
285 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.35 
 
 
285 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0504  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.47 
 
 
267 aa  51.6  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568309  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2423  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.33 
 
 
282 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4077  ThiF family protein  31.68 
 
 
266 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1956  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.74 
 
 
285 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3958  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1255  hypothetical protein  29.2 
 
 
255 aa  50.8  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000298288  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2567  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.74 
 
 
285 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450041  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1350  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.06 
 
 
284 aa  50.8  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0688  hypothetical protein  29.57 
 
 
271 aa  50.1  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0324843  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2998  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.21 
 
 
275 aa  50.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>