More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1172 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 232 aa  448  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  45.7 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  40.72 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  41.83 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 226 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  40.18 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 		 221 aa  132  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 227 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  39.37 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  35.65 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 220 aa  125  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  32.84 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 253 aa  118  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 189 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  32.79 
 
 		 184 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 124 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  44 
 
 		 124 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  45.05 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 117 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  33.33 
 
 		 94 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  33.33 
 
 		 94 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  25.76 
 
 		 146 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 93 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 118 aa  53.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 151 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 151 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 141 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 138 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 120 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  35.56 
 
 		 136 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 188 aa  52.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 144 aa  52  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  25.83 
 
 		 124 aa  52  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 98 aa  52  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 117 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 129 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  45.21 
 
 		 105 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 130 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 119 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 118 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 130 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0834  rhodanese-like domain-containing protein  36.63 
 
 		 155 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0871  rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 		 155 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2213  rhodanese-like domain-containing protein  36.63 
 
 		 155 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00171016  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1566  rhodanese-like domain-containing protein  36.63 
 
 		 155 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2884  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 133 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.301684 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0054  rhodanese-like domain-containing protein  36.63 
 
 		 155 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0184557  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  37.93 
 
 		 115 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 106 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 125 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4262  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 121 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264931  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0167  Rhodanese domain protein  29.75 
 
 		 117 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  40.21 
 
 		 111 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 104 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 98 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 129 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 142 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  36.08 
 
 		 113 aa  49.7  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 98 aa  49.7  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 		 174 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 119 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2219  regulatory protein ArsR  31.4 
 
 		 106 aa  49.3  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.372168  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 127 aa  49.3  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 129 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 129 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2181  regulatory protein, ArsR  31.4 
 
 		 106 aa  49.3  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  41.03 
 
 		 98 aa  49.3  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0963  rhodanese domain-containing protein  35.64 
 
 		 155 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>