More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1155 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 272 aa  530  1e-150  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  48.44 
 
 		 260 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 		 267 aa  231  9e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  50.78 
 
 		 449 aa  227  2e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1765  phosphomethylpyrimidine kinase  60.7 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.962126  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 450 aa  224  2e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  48.46 
 
 		 266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 		 271 aa  221  8e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  49.8 
 
 		 444 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  52.11 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1915  phosphomethylpyrimidine kinase  57.59 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2049  phosphomethylpyrimidine kinase  57.2 
 
 		 261 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281496  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  56.81 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  47.86 
 
 		 436 aa  217  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  52.9 
 
 		 274 aa  215  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  49.04 
 
 		 269 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 264 aa  214  9e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  46.51 
 
 		 260 aa  214  9e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  52.69 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 		 266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 		 270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 268 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 		 278 aa  212  5.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 		 270 aa  211  9e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 		 270 aa  211  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 		 270 aa  211  9e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 		 270 aa  211  9e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  45.66 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34580  phosphomethylpyrimidine kinase  51.29 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  48.84 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 		 273 aa  210  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  51.95 
 
 		 263 aa  209  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  52.31 
 
 		 271 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  46.51 
 
 		 266 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  46.69 
 
 		 262 aa  208  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 		 270 aa  208  8e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  43.14 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  46.44 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 		 270 aa  206  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 		 266 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  43.53 
 
 		 272 aa  205  7e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  45.1 
 
 		 270 aa  205  8e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 		 288 aa  204  9e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 		 288 aa  204  9e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  48.44 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  46.47 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 		 268 aa  203  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  49.41 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  48.86 
 
 		 268 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  46.79 
 
 		 268 aa  202  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  48.86 
 
 		 268 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  49.23 
 
 		 274 aa  202  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  46.51 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  43.58 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  50.39 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  47.29 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0915  phosphomethylpyrimidine kinase  49.63 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.315595 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  40.46 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  44.12 
 
 		 290 aa  199  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4277  phosphomethylpyrimidine kinase  52.85 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 270 aa  199  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  47.74 
 
 		 266 aa  198  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  47.91 
 
 		 268 aa  198  7.999999999999999e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  48.48 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  48.59 
 
 		 449 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  48.79 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  45.91 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  46.48 
 
 		 285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4962  phosphomethylpyrimidine kinase  51.91 
 
 		 266 aa  195  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  0.0189851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  46.91 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 264 aa  194  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  40.46 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  40.46 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  47.64 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  46.51 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1127  phosphomethylpyrimidine kinase  55.12 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  48.31 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  46.51 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  46.3 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 497 aa  193  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2688  phosphomethylpyrimidine kinase  48.7 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  41.25 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  41.25 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  40.75 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  45.29 
 
 		 285 aa  192  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 266 aa  192  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  44.75 
 
 		 266 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  51.88 
 
 		 267 aa  191  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  44.75 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0576  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  decreased coverage  0.00355637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>