More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1110 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1110  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
344 aa  678    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  42.09 
 
 
362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3026  histidinol-phosphate aminotransferase  43.06 
 
 
397 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.992363  normal  0.0418598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  40.23 
 
 
369 aa  209  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10880  histidinol-phosphate aminotransferase  44.13 
 
 
374 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  33.63 
 
 
351 aa  207  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1917  histidinol-phosphate aminotransferase  40.79 
 
 
453 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0201149  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3612  histidinol-phosphate aminotransferase  42.49 
 
 
377 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129757  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3241  histidinol-phosphate aminotransferase  40.4 
 
 
377 aa  199  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471866  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  38.14 
 
 
363 aa  198  9e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3162  histidinol-phosphate aminotransferase  41.79 
 
 
366 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00538361  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  35.73 
 
 
371 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  40.29 
 
 
356 aa  195  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3062  histidinol-phosphate aminotransferase  40.11 
 
 
377 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.649839  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3121  histidinol-phosphate aminotransferase  40.11 
 
 
377 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3078  histidinol-phosphate aminotransferase  40.11 
 
 
377 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.220176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1470  histidinol-phosphate aminotransferase  39.31 
 
 
372 aa  192  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0168842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
358 aa  192  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2959  histidinol-phosphate aminotransferase  40.76 
 
 
374 aa  192  9e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190767  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11616  histidinol-phosphate aminotransferase  39.6 
 
 
380 aa  192  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.289947 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  36.47 
 
 
355 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  40.29 
 
 
360 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3996  histidinol-phosphate aminotransferase  41.4 
 
 
361 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.784945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 
360 aa  189  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  38.04 
 
 
372 aa  189  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000115352 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2393  histidinol-phosphate aminotransferase  39.47 
 
 
375 aa  189  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3044  histidinol-phosphate aminotransferase  41.43 
 
 
362 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  39.88 
 
 
373 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.696784  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07350  histidinol-phosphate aminotransferase  39.09 
 
 
373 aa  186  6e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1092  histidinol-phosphate aminotransferase  37.78 
 
 
386 aa  180  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.72079  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22000  histidinol-phosphate aminotransferase  40.55 
 
 
380 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  38.05 
 
 
360 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1151  histidinol-phosphate aminotransferase  38.71 
 
 
367 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  35.76 
 
 
356 aa  177  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5721  histidinol-phosphate aminotransferase  42.13 
 
 
383 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3421  histidinol-phosphate aminotransferase  41 
 
 
358 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2024  histidinol-phosphate aminotransferase  36.49 
 
 
374 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3176  histidinol-phosphate aminotransferase  39.09 
 
 
378 aa  176  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  34.35 
 
 
355 aa  175  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1059  histidinol-phosphate aminotransferase  39.77 
 
 
406 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0743444  normal  0.133143 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  34.78 
 
 
350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1307  histidinol-phosphate aminotransferase  39 
 
 
387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1613  histidinol-phosphate aminotransferase  39.27 
 
 
379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7445  histidinol-phosphate aminotransferase  38.44 
 
 
370 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  31.25 
 
 
350 aa  173  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2896  histidinol-phosphate aminotransferase  38.44 
 
 
366 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00341068  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  32.49 
 
 
369 aa  172  6.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  35.14 
 
 
350 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  36.81 
 
 
369 aa  172  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  32.84 
 
 
350 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  34.92 
 
 
357 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  37 
 
 
362 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3195  histidinol-phosphate aminotransferase  41.59 
 
 
358 aa  170  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.505602  normal  0.19323 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  29.11 
 
 
358 aa  170  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  36.73 
 
 
363 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1263  histidinol-phosphate aminotransferase  37.61 
 
 
348 aa  169  9e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.136203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  32.12 
 
 
357 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  34.3 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  30.5 
 
 
349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  30.49 
 
 
351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  34.64 
 
 
373 aa  166  5.9999999999999996e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  34.64 
 
 
386 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.54 
 
 
358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  33.64 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  37.05 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  34.69 
 
 
368 aa  164  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 
353 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  32.11 
 
 
365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  32.17 
 
 
360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  34.6 
 
 
370 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22550  histidinol phosphate aminotransferase  37.95 
 
 
380 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  29.36 
 
 
353 aa  162  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  32.4 
 
 
362 aa  162  9e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  33.83 
 
 
350 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  31.5 
 
 
350 aa  161  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  31.53 
 
 
350 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  34.6 
 
 
356 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0761  histidinol-phosphate aminotransferase  34.76 
 
 
386 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  35.43 
 
 
383 aa  160  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  32.54 
 
 
373 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  35.96 
 
 
356 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  31.63 
 
 
351 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  34.71 
 
 
364 aa  159  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
386 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  34.65 
 
 
366 aa  159  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1902  histidinol-phosphate aminotransferase  37.77 
 
 
352 aa  158  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
383 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0153  histidinol-phosphate aminotransferase  35.11 
 
 
386 aa  157  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.936384  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  34.63 
 
 
385 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  28.27 
 
 
354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  35.03 
 
 
370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  32.43 
 
 
349 aa  156  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  33.72 
 
 
356 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  32 
 
 
348 aa  155  9e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  37.1 
 
 
371 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  29.63 
 
 
356 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  36.34 
 
 
355 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  36.34 
 
 
355 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  35.07 
 
 
365 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  29.05 
 
 
355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>