More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1084 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1084  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 461 aa  891    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  43.53 
 
 		 457 aa  327  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  41.33 
 
 		 460 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12303  dehydrogenase  38.6 
 
 		 459 aa  299  5e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10360  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.06 
 
 		 472 aa  253  6e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.92 
 
 		 470 aa  249  5e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  33.19 
 
 		 466 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  33.19 
 
 		 466 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.44 
 
 		 461 aa  219  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  33.62 
 
 		 461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.92 
 
 		 458 aa  204  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.58 
 
 		 470 aa  203  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  28.85 
 
 		 470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  28.85 
 
 		 470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  33.98 
 
 		 479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  34.34 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  30.89 
 
 		 457 aa  201  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.63 
 
 		 464 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  28.63 
 
 		 470 aa  199  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.63 
 
 		 470 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.92 
 
 		 470 aa  199  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  28.63 
 
 		 470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.63 
 
 		 470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.63 
 
 		 470 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.42 
 
 		 470 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.49 
 
 		 471 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.22 
 
 		 468 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0132  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.73 
 
 		 472 aa  196  6e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4261  FAD linked oxidase domain protein  35.33 
 
 		 455 aa  196  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371962  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  29.87 
 
 		 459 aa  196  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  30.54 
 
 		 466 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.22 
 
 		 470 aa  196  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.97 
 
 		 456 aa  195  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  34.43 
 
 		 459 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  34.59 
 
 		 464 aa  193  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  28.35 
 
 		 452 aa  193  6e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  29.85 
 
 		 466 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  30.28 
 
 		 459 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1087  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  32.08 
 
 		 471 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.62 
 
 		 453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  32.95 
 
 		 466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.06 
 
 		 457 aa  190  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.26 
 
 		 890 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.86 
 
 		 447 aa  189  7e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  37.56 
 
 		 441 aa  189  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.76 
 
 		 461 aa  189  9e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06074  oxidoreductase  33.84 
 
 		 472 aa  188  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000520479  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00853  oxidoreductase  33.84 
 
 		 472 aa  188  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00530367  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  34.53 
 
 		 460 aa  188  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  29.65 
 
 		 461 aa  187  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0140  oxidase, FAD-binding  33.88 
 
 		 461 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1357  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.04 
 
 		 474 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000325772  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0313  FAD linked oxidase domain protein  33.88 
 
 		 461 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6354  putative glycolate oxidase  33.99 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  27.55 
 
 		 456 aa  187  3e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.11 
 
 		 459 aa  187  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.95 
 
 		 457 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.95 
 
 		 457 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.95 
 
 		 457 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0311  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.84 
 
 		 473 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.54 
 
 		 459 aa  187  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  33.26 
 
 		 462 aa  186  8e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  31.85 
 
 		 498 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.04 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  30.89 
 
 		 461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0269  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.4 
 
 		 467 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000254872  hitchhiker  0.000000323322 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4399  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.03 
 
 		 484 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177563  normal  0.114484 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  31.75 
 
 		 470 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.19 
 
 		 462 aa  184  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.13 
 
 		 460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4582  FAD linked oxidase domain protein  29.37 
 
 		 477 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000242662  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1013  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.58 
 
 		 466 aa  183  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  32.18 
 
 		 458 aa  182  9.000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  31.66 
 
 		 503 aa  182  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.81 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  33.41 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  30.13 
 
 		 480 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  30.13 
 
 		 476 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.81 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0723  FAD linked oxidase-like protein  30.45 
 
 		 470 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  32.28 
 
 		 464 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  34.86 
 
 		 455 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0673  FAD linked oxidase domain protein  33.56 
 
 		 483 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  28.18 
 
 		 470 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  31.08 
 
 		 485 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1885  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.85 
 
 		 492 aa  181  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78076  hitchhiker  0.00459775 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4851  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.96 
 
 		 472 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1650  glycolate oxidase subunit D  29.74 
 
 		 492 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.054636 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.45 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  30.67 
 
 		 460 aa  180  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.25 
 
 		 459 aa  181  4e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.4 
 
 		 469 aa  180  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.42 
 
 		 464 aa  181  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5207  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.2 
 
 		 465 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0410  hypothetical protein  31.18 
 
 		 464 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.622003  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.16 
 
 		 887 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  27.65 
 
 		 460 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5386  FAD linked oxidase-like  30.04 
 
 		 472 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  31.47 
 
 		 499 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5061  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.06 
 
 		 473 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>