154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1064 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  100 
 
 		 478 aa  909    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  36.16 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  35.41 
 
 		 474 aa  183  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  36.91 
 
 		 466 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  36.49 
 
 		 467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  31.98 
 
 		 510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  35.01 
 
 		 464 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  33.88 
 
 		 468 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  36.04 
 
 		 475 aa  149  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  33.89 
 
 		 448 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  34.65 
 
 		 529 aa  143  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  34.61 
 
 		 498 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  32.15 
 
 		 634 aa  140  6e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  36.17 
 
 		 511 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  31.03 
 
 		 509 aa  138  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  34.25 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  32.63 
 
 		 529 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  32.99 
 
 		 555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  36.58 
 
 		 531 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  36.58 
 
 		 531 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0990  protein of unknown function DUF1212  33.19 
 
 		 465 aa  123  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126983  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  36.05 
 
 		 531 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  30.36 
 
 		 497 aa  113  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  30.36 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  22.65 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  29.22 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  28.51 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  27.2 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  25.61 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  28.34 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  27.02 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  27.6 
 
 		 250 aa  69.7  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  28.69 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1521  hypothetical protein  32.06 
 
 		 150 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  27.17 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  27.17 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  25.29 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  35.05 
 
 		 159 aa  65.5  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  32.84 
 
 		 156 aa  65.9  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0854  membrane spanning protein  37.21 
 
 		 142 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.607256 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  25.1 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  23.46 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  30.65 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000149992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  26.77 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  25.57 
 
 		 253 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  28.24 
 
 		 163 aa  62  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3690  hypothetical protein  35.59 
 
 		 153 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  26.64 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2927  hypothetical protein  30.92 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  26.49 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  29.8 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00804  hypothetical protein  31.78 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2596  hypothetical protein  31.23 
 
 		 281 aa  59.7  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.517735  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  25.42 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  31.01 
 
 		 143 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0958  hypothetical protein  35.79 
 
 		 155 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  25.21 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  35.05 
 
 		 156 aa  58.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1713  hypothetical protein  31.88 
 
 		 140 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  24.47 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2857  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  57.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00177194  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  25.51 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1008  hypothetical protein  34.74 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  26.64 
 
 		 259 aa  57  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  23.81 
 
 		 253 aa  57  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  23.81 
 
 		 253 aa  57  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  25.31 
 
 		 266 aa  57  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1962  protein of unknown function DUF1212  28.39 
 
 		 258 aa  57  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0150285  hitchhiker  0.00184472 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4959  hypothetical protein  30.53 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.375809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4866  hypothetical protein  30.53 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4953  hypothetical protein  30.53 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4900  hypothetical protein  30.53 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  25.91 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4799  hypothetical protein  30.53 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.570717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0521  hypothetical protein  28.68 
 
 		 157 aa  56.2  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650808 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  26.74 
 
 		 289 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  34.72 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  31.01 
 
 		 157 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  25.42 
 
 		 266 aa  56.6  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0365  membrane protein  31.09 
 
 		 163 aa  55.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0558  hypothetical protein  30.28 
 
 		 156 aa  55.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  26.78 
 
 		 253 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  25.31 
 
 		 266 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3837  hypothetical protein  31.78 
 
 		 156 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  25.51 
 
 		 253 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  31.58 
 
 		 157 aa  55.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4595  hypothetical protein  30.53 
 
 		 157 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.2901e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4956  hypothetical protein  30.53 
 
 		 157 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000176607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3692  hypothetical protein  30.53 
 
 		 157 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000191847  hitchhiker  0.00156887 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  27.31 
 
 		 261 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4903  hypothetical protein  30.53 
 
 		 157 aa  55.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105362  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3634  conserved hypothetical protein  29.47 
 
 		 157 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501605  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  25.62 
 
 		 253 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  25.62 
 
 		 253 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4908  hypothetical protein  29.47 
 
 		 155 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000105331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  28.44 
 
 		 422 aa  53.5  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  26 
 
 		 253 aa  53.9  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>