143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1053 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1053  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 		 357 aa  697    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  32.53 
 
 		 245 aa  109  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1560  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.53 
 
 		 344 aa  107  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0396798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.09 
 
 		 329 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2086  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.18 
 
 		 344 aa  106  7e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  23.9 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  26.9 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  24.67 
 
 		 334 aa  99.8  7e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.03 
 
 		 343 aa  99.8  7e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0449  lipoate-protein ligase  26.28 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0102299  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  31.8 
 
 		 325 aa  96.7  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  22.77 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  25.56 
 
 		 337 aa  94  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  23.53 
 
 		 329 aa  92.8  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.73 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.93 
 
 		 345 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  32.27 
 
 		 327 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05080  lipoate-protein ligase  23.45 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.341449  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  24.33 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  23.26 
 
 		 329 aa  88.6  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  23.16 
 
 		 329 aa  87  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  23.16 
 
 		 329 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  23.51 
 
 		 329 aa  86.7  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  22.79 
 
 		 329 aa  85.9  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  23.16 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  23.16 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  23.16 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  23.16 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  23.16 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  23.16 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  23.16 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  23.16 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  24.32 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.81 
 
 		 530 aa  83.2  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  25.1 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  25 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.17 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  23.49 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  29.58 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  30.74 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.58 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  19.05 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0197  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.14 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0070  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.41 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2465  lipoate-protein ligase A  27.3 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  22.3 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.69 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04262  lipoate-protein ligase A  25.25 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2034  biotin/lipoate A/B protein ligase  25 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  30.59 
 
 		 358 aa  75.9  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04227  hypothetical protein  25.25 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4621  lipoate-protein ligase A  25.25 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4985  lipoate-protein ligase A  25.25 
 
 		 338 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3670  lipoate-protein ligase A  25.25 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  27.09 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.14 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4933  lipoate-protein ligase A  25.32 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4987  lipoate-protein ligase A  25.25 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4935  lipoate-protein ligase A  25.25 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.672461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4933  lipoate-protein ligase A  25.57 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4899  lipoate-protein ligase A  24.92 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1733  lipoate-protein ligase A  25.08 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2604  lipoate-protein ligase A  25.08 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1839  lipoate-protein ligase A  25.08 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4985  lipoate-protein ligase A  24.92 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  27.16 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.77 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  23.26 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5901  unknown domain/lipoate-protein ligase A fusion protein  25.25 
 
 		 562 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3612  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.09 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0376  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.93 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  19.27 
 
 		 328 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0386  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.93 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  19.27 
 
 		 328 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1056  lipoate-protein ligase A  22.61 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  26.81 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.95 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4028  lipoate-protein ligase A  24.67 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4826  lipoate-protein ligase A  24.59 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  27.27 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1000  lipoate-protein ligase A  24.01 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.58 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2162  lipoate-protein ligase A  23.45 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  28.87 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1629  lipoate-protein ligase A  27.43 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.21 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0545  lipoate-protein ligase A  25.57 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0965348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.94 
 
 		 261 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.03 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.55 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.52 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.52 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1480  lipoate-protein ligase  22.95 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.521497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  30.05 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2894  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.57 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  27.66 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13820  lipoate-protein ligase A  30.23 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1542  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  21.71 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.54 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>