More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1027 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1027  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
539 aa  1096    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0505944  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  42.97 
 
 
528 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1984  AMP-dependent synthetase and ligase  44.66 
 
 
552 aa  401  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  42.97 
 
 
528 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  42.13 
 
 
536 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0322  AMP-dependent synthetase and ligase  37.82 
 
 
531 aa  360  5e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3261  AMP-dependent synthetase and ligase  38.51 
 
 
534 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  39.39 
 
 
534 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.097494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0674  putative fatty-acid--CoA ligase  39.05 
 
 
533 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.11643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2203  AMP-dependent synthetase and ligase  38.12 
 
 
534 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4559  acyl-CoA synthetase  41.25 
 
 
529 aa  347  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  41.52 
 
 
540 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  40.85 
 
 
532 aa  338  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3202  AMP-dependent synthetase and ligase  37.09 
 
 
533 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0351635  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  39.61 
 
 
530 aa  331  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4202  acyl-CoA synthetase  41.12 
 
 
534 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269622  hitchhiker  0.00584314 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0642  acyl-CoA synthetase  38.13 
 
 
529 aa  317  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95301  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  38.13 
 
 
537 aa  316  6e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  38.13 
 
 
537 aa  316  6e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  38.13 
 
 
537 aa  316  6e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2882  acyl-CoA synthetase  39.06 
 
 
557 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.35 
 
 
519 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.19 
 
 
524 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  38.8 
 
 
525 aa  300  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  37.12 
 
 
511 aa  300  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  37.66 
 
 
520 aa  297  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  37.67 
 
 
513 aa  293  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  37.98 
 
 
521 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 
520 aa  292  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  35.38 
 
 
517 aa  286  7e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.83 
 
 
518 aa  280  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.64 
 
 
518 aa  277  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 
509 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.51 
 
 
518 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.33 
 
 
518 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 
509 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 
527 aa  273  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 
520 aa  272  9e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.45 
 
 
556 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 
1043 aa  272  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.45 
 
 
556 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.45 
 
 
556 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.33 
 
 
518 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  34.85 
 
 
522 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 
520 aa  268  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  36.87 
 
 
516 aa  267  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0832  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.89 
 
 
518 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0778  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.33 
 
 
518 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.89 
 
 
518 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0876  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.89 
 
 
518 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.33 
 
 
518 aa  264  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 
518 aa  264  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.23 
 
 
570 aa  263  8e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 
499 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  35.35 
 
 
508 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 
525 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.4 
 
 
579 aa  259  8e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  34.54 
 
 
504 aa  258  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19550  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.99 
 
 
533 aa  258  3e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  35.37 
 
 
565 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 
534 aa  256  9e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  33.54 
 
 
508 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  35.58 
 
 
526 aa  255  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 
518 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.72 
 
 
514 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  36.72 
 
 
520 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
501 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  34.99 
 
 
515 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2709  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 
531 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0786644  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 
526 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 
530 aa  252  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 
516 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 
528 aa  250  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5576  acyl-CoA synthetase  34.51 
 
 
519 aa  249  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1402  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 
532 aa  248  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 
518 aa  249  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 
511 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 
518 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.96 
 
 
534 aa  248  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0641194 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0606  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 
560 aa  247  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0119  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 
506 aa  246  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.976048  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.65 
 
 
517 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.65 
 
 
517 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.65 
 
 
517 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 
508 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
518 aa  244  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 
531 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  32.27 
 
 
530 aa  243  7e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 
523 aa  243  7.999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 
566 aa  243  9e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  31.1 
 
 
575 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.15 
 
 
525 aa  240  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 
509 aa  241  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  29.47 
 
 
496 aa  240  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  29.47 
 
 
496 aa  240  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4181  acyl-CoA synthetase  32.94 
 
 
522 aa  240  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  31.05 
 
 
576 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.93 
 
 
512 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
534 aa  239  6.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  34.3 
 
 
520 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>