176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0878 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0878  dihydroxyacetone kinase, L subunit  100 
 
 
209 aa  409  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4780  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.15 
 
 
209 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.512432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2045  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.27 
 
 
210 aa  145  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1767  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.15 
 
 
211 aa  144  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1026  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.69 
 
 
212 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0152559  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2073  dihydroxyacetone kinase subunit L  40.31 
 
 
216 aa  142  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0235  dihydroxyacetone kinase family protein  40.2 
 
 
208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.229043  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001637  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase ADP-binding subunit DhaL  41.06 
 
 
211 aa  138  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1555  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.23 
 
 
206 aa  135  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1343  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.11 
 
 
204 aa  134  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000571378  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1660  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.44 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015384  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4271  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.62 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207338 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1067  dihydroxyacetone kinase, subunit L  48.65 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0073  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.53 
 
 
214 aa  131  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.706959  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2004  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.21 
 
 
215 aa  131  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.419483  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1942  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  44.57 
 
 
210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0284068 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  44.02 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1179  DAK2 domain-containing protein  40.91 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2346  dihydroxyacetone kinase, L subunit  49.48 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.516826  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2583  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.68 
 
 
210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29370  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  44.39 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6113  dihydroxyacetone kinase, L subunit  46.73 
 
 
208 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2221  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.21 
 
 
204 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2008  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.33 
 
 
210 aa  124  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2329  dihydroxyacetone kinase, L subunit  47.76 
 
 
211 aa  124  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2617  dihydroxyacetone kinase, L subunit  51.1 
 
 
205 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0276564  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4110  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.84 
 
 
220 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0295747 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4857  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  42.19 
 
 
210 aa  122  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0173  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.67 
 
 
210 aa  122  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1303  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  44.57 
 
 
210 aa  121  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01174  dihydroxyacetone kinase, C-terminal domain protein  44.57 
 
 
210 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2449  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.57 
 
 
210 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01184  hypothetical protein  44.57 
 
 
210 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1358  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  44.57 
 
 
210 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3298  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.11 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2427  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  44.57 
 
 
210 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.52079  normal  0.545105 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0336  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.71 
 
 
210 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1907  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.61 
 
 
215 aa  118  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2344  DAK2 domain-containing protein  38.02 
 
 
191 aa  118  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3916  dihydroxyacetone kinase, L subunit  47.89 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3047  dihydroxyacetone kinase, L subunit  45.1 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1102  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.93 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1458  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.06 
 
 
213 aa  115  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.031951  normal  0.416542 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2563  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.39 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.389058  normal  0.0624856 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0674  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.63 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.13581  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0689  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.63 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0402893  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1459  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.21 
 
 
252 aa  111  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2057  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.32 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0299195  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23890  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  44.51 
 
 
271 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0484883  normal  0.421775 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1155  dihydroxyacetone kinase, L subunit  45.76 
 
 
211 aa  109  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4394  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.5 
 
 
211 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1081  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.33 
 
 
199 aa  107  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1651  dihydroxyacetone kinase family protein  34.74 
 
 
192 aa  105  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1571  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.98 
 
 
201 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0215436  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03260  Glycerone kinase  34.17 
 
 
216 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000533446  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0705  dihydroxyacetone kinase, subunit L  37.62 
 
 
212 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4661  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.42 
 
 
215 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.439901 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  37.37 
 
 
567 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3125  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.13 
 
 
214 aa  99.8  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2200  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.83 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530295  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0973  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.65 
 
 
216 aa  99.4  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19322  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0039  dihydroxyacetone phosphatase family protein  36.74 
 
 
212 aa  98.2  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4070  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.38 
 
 
213 aa  97.8  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1638  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.39 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.275344  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0080  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.48 
 
 
218 aa  97.4  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0961  dihydroxyacetone kinase, subunit L  36.92 
 
 
211 aa  96.3  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000657721  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1105  dihydroxyacetone kinase, subunit L  36.92 
 
 
211 aa  96.3  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1402  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.47 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal  0.808162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2433  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.73 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.107331  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1263  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.49 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3824  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.9 
 
 
213 aa  92.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234592  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  36.87 
 
 
567 aa  92  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3210  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.77 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0650  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.58 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0141931  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4752  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.39 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0429021  normal  0.328024 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6365  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.3 
 
 
205 aa  89  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2458  Dak phosphatase  40.1 
 
 
213 aa  88.6  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.85851  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0355  dihydroxyacetone kinase, subunit L  33.15 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  35.75 
 
 
612 aa  87.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4072  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.47 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111726  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0411  dihydroxyacetone kinase  38.54 
 
 
587 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1404  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.65 
 
 
221 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172962  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  32.21 
 
 
598 aa  85.1  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0948  hypothetical protein  33.51 
 
 
224 aa  84.7  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.168342  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3418  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.51 
 
 
224 aa  84.7  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102926  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5632  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.38 
 
 
210 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431104  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1569  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.47 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.460675  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2565  Dak phosphatase  33.51 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3285  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.02 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3826  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.83 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1105  Glycerone kinase  37.88 
 
 
572 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4072  Glycerone kinase  37.57 
 
 
619 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.572793  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1341  Dak phosphatase  36.13 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22050  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.41 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  32.87 
 
 
589 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4000  Glycerone kinase  35.52 
 
 
560 aa  79.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0457364  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0884  dihydroxyacetone kinase  40.74 
 
 
616 aa  79  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  35.08 
 
 
566 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2599  dihydroxyacetone kinase  35.94 
 
 
581 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1808  dihydroxyacetone kinase family protein  35.96 
 
 
219 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>