190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0877 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  100 
 
 
333 aa  657    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  61.82 
 
 
332 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  58.18 
 
 
332 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  62.05 
 
 
332 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  53.17 
 
 
332 aa  376  1e-103  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  52.42 
 
 
329 aa  369  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  57.58 
 
 
332 aa  365  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  58.18 
 
 
331 aa  360  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  53.47 
 
 
332 aa  358  6e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  54.24 
 
 
333 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0172  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  61.52 
 
 
333 aa  352  4e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  55.56 
 
 
332 aa  351  1e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  54.24 
 
 
333 aa  350  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1457  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  63.64 
 
 
331 aa  347  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217396  normal  0.856558 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.7 
 
 
329 aa  345  6e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  60.61 
 
 
333 aa  345  6e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  54.55 
 
 
333 aa  342  5e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  53.94 
 
 
333 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4782  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  49.58 
 
 
355 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  54.85 
 
 
333 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  50.14 
 
 
354 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  51.36 
 
 
583 aa  332  4e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  51.36 
 
 
583 aa  332  4e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  51.36 
 
 
583 aa  331  9e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  57.58 
 
 
333 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  47.75 
 
 
582 aa  328  6e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  54.24 
 
 
332 aa  328  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1458  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  56.84 
 
 
333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  55.76 
 
 
333 aa  325  5e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23900  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  56.97 
 
 
331 aa  324  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0662069  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2009  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  49.3 
 
 
354 aa  324  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  49.43 
 
 
354 aa  323  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  51.06 
 
 
583 aa  322  6e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  50.15 
 
 
583 aa  322  6e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  51.66 
 
 
583 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.54 
 
 
364 aa  321  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  51.66 
 
 
583 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  51.36 
 
 
583 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2201  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  46.67 
 
 
331 aa  320  3e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000263646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  51.66 
 
 
583 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  51.36 
 
 
583 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  51.36 
 
 
583 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1154  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  59.4 
 
 
335 aa  315  5e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543562  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1080  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  48.29 
 
 
325 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.66 
 
 
356 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01175  dihydroxyacetone kinase, N-terminal domain protein  45.66 
 
 
356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2448  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.66 
 
 
356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1941  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.66 
 
 
356 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0517776 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2426  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.66 
 
 
356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.260612 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01185  hypothetical protein  45.66 
 
 
356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.898254  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.38 
 
 
369 aa  311  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1346  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.38 
 
 
356 aa  310  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3048  Glycerone kinase  55.26 
 
 
330 aa  309  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0960  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  49.09 
 
 
329 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101892  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1104  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  49.09 
 
 
329 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  49.07 
 
 
331 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4272  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.33 
 
 
356 aa  306  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  52.87 
 
 
567 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  47.76 
 
 
695 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0706  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.73 
 
 
327 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.598011  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  47.53 
 
 
331 aa  300  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  53.03 
 
 
332 aa  300  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4858  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.63 
 
 
354 aa  300  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  56.06 
 
 
332 aa  298  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  48.01 
 
 
333 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5631  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  49.09 
 
 
329 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735758  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3126  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  50.61 
 
 
331 aa  296  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76772  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6364  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.88 
 
 
329 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0674086  normal  0.470329 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  52 
 
 
572 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  49.39 
 
 
334 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001638  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase dihydroxyacetone binding subunit DhaK  45.76 
 
 
352 aa  292  6e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0673  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.67 
 
 
322 aa  291  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.384752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0688  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.67 
 
 
322 aa  291  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.03804  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2347  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  55.89 
 
 
333 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  52.49 
 
 
567 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  48.35 
 
 
700 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  46.97 
 
 
333 aa  288  7e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2360  dihydroxyacetone kinase family protein  41.1 
 
 
335 aa  288  9e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  51.36 
 
 
569 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  51.36 
 
 
569 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  51.82 
 
 
616 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.71 
 
 
320 aa  287  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  51.36 
 
 
566 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  50.75 
 
 
333 aa  287  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0040  dihydroxyacetone kinase family protein  49.39 
 
 
329 aa  286  4e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0697  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  47.9 
 
 
327 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3316  Glycerone kinase  48.92 
 
 
333 aa  286  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  45.18 
 
 
694 aa  285  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  48.79 
 
 
330 aa  286  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0651  Glycerone kinase  44.17 
 
 
334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0661746  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  50.46 
 
 
567 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  48.18 
 
 
334 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  51.96 
 
 
566 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1401  Glycerone kinase  46.58 
 
 
331 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0864848  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  46.08 
 
 
694 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.88 
 
 
330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1716  dihydroxyacetone kinase  46.56 
 
 
569 aa  267  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03250  Glycerone kinase  41.61 
 
 
334 aa  265  5.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000458534  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1909  Glycerone kinase  46.18 
 
 
331 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.366009  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1639  Dak kinase  39.39 
 
 
333 aa  264  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0196246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>