More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0738 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0738  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
346 aa  678    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0293389  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  37.31 
 
 
349 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  40.11 
 
 
367 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  39.44 
 
 
359 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  38.14 
 
 
359 aa  205  8e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  30.57 
 
 
820 aa  205  9e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  37.96 
 
 
359 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  37.18 
 
 
364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  39.71 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  38.35 
 
 
359 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  38.35 
 
 
359 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  38.35 
 
 
359 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  37.68 
 
 
359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  34.51 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  33.8 
 
 
370 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  36.34 
 
 
357 aa  195  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  35.9 
 
 
833 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  33.88 
 
 
832 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  36.26 
 
 
347 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  36.46 
 
 
357 aa  193  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  35.36 
 
 
827 aa  193  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  34.22 
 
 
361 aa  193  4e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  31.04 
 
 
712 aa  193  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  34.74 
 
 
834 aa  192  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  36.2 
 
 
833 aa  193  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.81 
 
 
828 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  32.58 
 
 
370 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  38.1 
 
 
364 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  31.62 
 
 
828 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  33.92 
 
 
361 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
827 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  31.62 
 
 
830 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  39.42 
 
 
347 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  37.32 
 
 
363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  36.29 
 
 
364 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  34.68 
 
 
842 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  29.86 
 
 
820 aa  189  8e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  37.43 
 
 
365 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  32.46 
 
 
836 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  38.39 
 
 
366 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  31.86 
 
 
370 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
835 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  36.18 
 
 
854 aa  186  4e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  29.86 
 
 
816 aa  185  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  32.93 
 
 
835 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  31.23 
 
 
835 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6337  Nucleotidyl transferase  38.14 
 
 
359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  31.11 
 
 
810 aa  183  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  31.93 
 
 
348 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  33.82 
 
 
841 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  35.51 
 
 
843 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  30 
 
 
828 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  35.42 
 
 
818 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  29.18 
 
 
818 aa  179  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  30.34 
 
 
830 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  28.34 
 
 
776 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.66 
 
 
836 aa  176  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  30.61 
 
 
784 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  31.21 
 
 
836 aa  176  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.63 
 
 
836 aa  176  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  31.14 
 
 
840 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  30.61 
 
 
784 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.61 
 
 
784 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  30.03 
 
 
784 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  30.61 
 
 
784 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  34.2 
 
 
828 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  36.28 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.32 
 
 
784 aa  173  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  28.8 
 
 
843 aa  173  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  40.8 
 
 
326 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  30.33 
 
 
842 aa  172  7.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  30.32 
 
 
784 aa  172  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  30.75 
 
 
832 aa  172  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  33.24 
 
 
821 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  30.32 
 
 
784 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  30.03 
 
 
784 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  30.03 
 
 
784 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  31.64 
 
 
835 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  32.29 
 
 
364 aa  170  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  30.86 
 
 
343 aa  170  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  30.57 
 
 
832 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  30.29 
 
 
841 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  30.82 
 
 
785 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.33 
 
 
842 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  32.04 
 
 
837 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  34.1 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  29.84 
 
 
842 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0928  nucleotidyl transferase  35.39 
 
 
359 aa  157  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.20613 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  32.1 
 
 
362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  29.85 
 
 
392 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0890  nucleotidyl transferase  35.65 
 
 
359 aa  155  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  30.06 
 
 
392 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1971  nucleotidyl transferase  36 
 
 
358 aa  153  5e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  31.29 
 
 
388 aa  152  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  29.59 
 
 
392 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  29.1 
 
 
399 aa  147  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1620  nucleotidyl transferase  33.97 
 
 
360 aa  147  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131189  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  32.52 
 
 
329 aa  146  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.29 
 
 
389 aa  145  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  30.95 
 
 
387 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>