More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0652 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  100 
 
 
420 aa  812    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  46.81 
 
 
433 aa  286  5.999999999999999e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  39.41 
 
 
411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  45.07 
 
 
438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  38.05 
 
 
413 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  41.5 
 
 
420 aa  261  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  38.37 
 
 
411 aa  260  4e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  37.41 
 
 
411 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  45.81 
 
 
427 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  36.45 
 
 
417 aa  250  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  41.16 
 
 
421 aa  249  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  36.34 
 
 
412 aa  250  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  38.89 
 
 
413 aa  250  4e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  38.69 
 
 
414 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  36.52 
 
 
412 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  37.32 
 
 
413 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  35.99 
 
 
413 aa  246  8e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  36.1 
 
 
412 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  35.97 
 
 
416 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  36.43 
 
 
420 aa  242  7e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  37.03 
 
 
412 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  36.52 
 
 
412 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  36.32 
 
 
423 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  35.11 
 
 
412 aa  240  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  35.38 
 
 
415 aa  239  9e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  37.32 
 
 
418 aa  238  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  38.92 
 
 
432 aa  238  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  36.27 
 
 
412 aa  237  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  36.27 
 
 
412 aa  237  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  36.27 
 
 
412 aa  237  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  34.36 
 
 
415 aa  236  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  36.27 
 
 
412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  36.27 
 
 
412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  34.78 
 
 
419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  36.02 
 
 
412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  36.27 
 
 
412 aa  234  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  42.82 
 
 
423 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  37.71 
 
 
415 aa  233  6e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  36.47 
 
 
408 aa  231  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  36.8 
 
 
425 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  32.94 
 
 
415 aa  231  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  36.12 
 
 
408 aa  229  8e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  35.99 
 
 
408 aa  228  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  35.49 
 
 
417 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  41.57 
 
 
432 aa  226  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  36.45 
 
 
416 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  35.92 
 
 
418 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  35.73 
 
 
416 aa  223  4.9999999999999996e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  36.45 
 
 
416 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  39.95 
 
 
419 aa  222  9e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  42.18 
 
 
408 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  36.25 
 
 
418 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.41 
 
 
430 aa  220  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  32.36 
 
 
401 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  35.73 
 
 
415 aa  219  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  41.19 
 
 
408 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  33.17 
 
 
430 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.06 
 
 
431 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  37.9 
 
 
414 aa  216  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  33 
 
 
408 aa  216  9e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  41.54 
 
 
410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  41.69 
 
 
408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  34.47 
 
 
416 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  35.06 
 
 
415 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  34.39 
 
 
420 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  33.02 
 
 
417 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.21 
 
 
424 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  33.82 
 
 
406 aa  211  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  39.53 
 
 
414 aa  210  4e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  34.43 
 
 
423 aa  209  8e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  35.48 
 
 
424 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  38.16 
 
 
429 aa  207  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  39.74 
 
 
423 aa  206  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  35.99 
 
 
414 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.9 
 
 
433 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  38.13 
 
 
425 aa  203  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  36.17 
 
 
424 aa  202  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  37.13 
 
 
418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.99 
 
 
429 aa  199  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  34.14 
 
 
412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0856  competence/damage-inducible protein CinA  39.52 
 
 
399 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0938297  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  34.38 
 
 
424 aa  196  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.21 
 
 
424 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  31.99 
 
 
416 aa  195  1e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  33.81 
 
 
424 aa  195  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  39.94 
 
 
419 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  35.89 
 
 
424 aa  193  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  36.87 
 
 
437 aa  193  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  31.65 
 
 
424 aa  193  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  36.32 
 
 
414 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  35.24 
 
 
413 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0747  competence/damage-inducible protein CinA  38.08 
 
 
400 aa  190  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.543966  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  30.99 
 
 
403 aa  189  8e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1729  competence/damage-inducible protein CinA  32.3 
 
 
401 aa  187  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1157  competence/damage-inducible protein CinA  36.69 
 
 
443 aa  186  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  37.76 
 
 
430 aa  186  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  35.59 
 
 
414 aa  186  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  33.49 
 
 
424 aa  186  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  34.5 
 
 
423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  33.01 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>