More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0566 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0566  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 
253 aa  507  1e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  54.92 
 
 
250 aa  278  8e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  51.2 
 
 
261 aa  269  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  51.2 
 
 
261 aa  268  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  51.2 
 
 
261 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  51.2 
 
 
261 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  51.2 
 
 
261 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  51.2 
 
 
261 aa  268  7e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  51.2 
 
 
261 aa  268  7e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  51.2 
 
 
261 aa  268  7e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  50.8 
 
 
261 aa  267  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  50.8 
 
 
261 aa  267  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  51.2 
 
 
261 aa  267  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  49.19 
 
 
253 aa  263  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  50.41 
 
 
259 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0708  FeS assembly ATPase SufC  51.39 
 
 
260 aa  261  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0304  FeS assembly ATPase SufC  51 
 
 
260 aa  261  6e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.553044  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  49.19 
 
 
253 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  50.41 
 
 
259 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  52.94 
 
 
254 aa  260  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  49.19 
 
 
253 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0265  FeS assembly ATPase SufC  50.41 
 
 
248 aa  258  9e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000246203  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  50.4 
 
 
261 aa  256  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  46.48 
 
 
263 aa  254  9e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  50 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  50.2 
 
 
249 aa  252  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  52 
 
 
257 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  50 
 
 
261 aa  250  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3080  FeS assembly ATPase SufC  51.42 
 
 
257 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190526  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5984  ABC transporter  51.02 
 
 
257 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  50.59 
 
 
257 aa  249  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2038  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  46.8 
 
 
266 aa  248  6e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  49.6 
 
 
264 aa  248  6e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  50.39 
 
 
255 aa  248  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3307  FeS assembly ATPase SufC  51.01 
 
 
257 aa  248  8e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000620228 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00811  ABC transporter, ATP binding component  45.71 
 
 
260 aa  248  8e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  47.56 
 
 
256 aa  247  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0074  FeS assembly ATPase SufC  45.75 
 
 
261 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1142  FeS assembly ATPase SufC  48.77 
 
 
250 aa  247  1e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3675  FeS assembly ATPase SufC  48.64 
 
 
256 aa  247  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426294  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  50.59 
 
 
252 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  47.93 
 
 
247 aa  246  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  50.2 
 
 
256 aa  246  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  46.18 
 
 
248 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2735  FeS assembly ATPase SufC  48.25 
 
 
256 aa  246  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1984  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  50.62 
 
 
253 aa  245  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192658  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0960  FeS assembly ATPase SufC  48.61 
 
 
259 aa  245  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531756  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0416  FeS assembly ATPase SufC  48.41 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  46.83 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  47.81 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5151  FeS assembly ATPase SufC  50.79 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0427  FeS assembly ATPase SufC  48.41 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  48.21 
 
 
254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  50.2 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2337  FeS assembly ATPase SufC  47.81 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  48 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0785  FeS assembly ATPase SufC  48.93 
 
 
251 aa  242  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00319351  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  47.56 
 
 
256 aa  243  3e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  48.03 
 
 
250 aa  242  5e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  50.4 
 
 
254 aa  241  6e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00841  ABC transporter, ATP binding component  44.94 
 
 
261 aa  241  6e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.520041  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1360  FeS assembly ATPase SufC  48.37 
 
 
255 aa  241  7e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2106  FeS assembly ATPase SufC  49.59 
 
 
265 aa  241  7.999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.118871  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  46.83 
 
 
250 aa  241  9e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  48.58 
 
 
257 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  48.8 
 
 
260 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0891  FeS assembly ATPase SufC  46.09 
 
 
265 aa  241  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4730  FeS assembly ATPase SufC  48.02 
 
 
256 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11491  ATP-binding protein ABC transporter  48.25 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209991  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21920  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  49.19 
 
 
253 aa  239  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1674  FeS assembly ATPase SufC  50.59 
 
 
252 aa  239  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  49.19 
 
 
250 aa  238  5e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1848  FeS assembly ATPase SufC  49.19 
 
 
262 aa  238  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000939138 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0405  FeS assembly ATPase SufC  47.97 
 
 
262 aa  238  5e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.300963  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0666  FeS assembly ATPase SufC  44.49 
 
 
246 aa  238  5.999999999999999e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00831  ABC transporter, ATP binding component  44.13 
 
 
261 aa  238  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  49.18 
 
 
250 aa  238  9e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  49.01 
 
 
251 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  48.21 
 
 
258 aa  236  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2389  FeS assembly ATPase SufC  48.19 
 
 
281 aa  236  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2960  FeS assembly ATPase SufC  47.56 
 
 
253 aa  236  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01361  ABC transporter, ATP binding component  46.09 
 
 
263 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2385  FeS assembly ATPase SufC  48.8 
 
 
257 aa  236  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0576904  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0656  FeS assembly ATPase SufC  43.37 
 
 
257 aa  236  4e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1435  FeS assembly ATPase SufC  46.09 
 
 
263 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.157604  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0697  FeS assembly ATPase SufC  48.37 
 
 
262 aa  236  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.85326  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1663  FeS assembly ATPase SufC  50.6 
 
 
264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.160524  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2067  FeS assembly ATPase SufC  48.78 
 
 
267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.962142  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1137  FeS assembly ATPase SufC  50.6 
 
 
252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.324053  normal  0.0277832 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14650  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  48.18 
 
 
251 aa  235  6e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1143  FeS assembly ATPase SufC  48.59 
 
 
253 aa  235  6e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116677  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0604  Fe-S cluster assembly ABC transporter ATPase  47.97 
 
 
259 aa  234  8e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.164231  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2507  FeS assembly ATPase SufC  47.84 
 
 
258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2281  FeS assembly ATPase SufC  47.15 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2278  FeS assembly ATPase SufC  48.81 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000491334  normal  0.0474904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  46.91 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03031  ABC transporter, ATP binding component  48.45 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  47.83 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  48.37 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  46.8 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>