85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0554 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  100 
 
 		 296 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  82.09 
 
 		 325 aa  431  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  56.36 
 
 		 454 aa  295  4e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  47.62 
 
 		 291 aa  256  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  46.76 
 
 		 286 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  44.91 
 
 		 288 aa  218  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  40.41 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  40.07 
 
 		 291 aa  198  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  35.74 
 
 		 299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  32.11 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  31.27 
 
 		 306 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  29.84 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  32.41 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  29.97 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  30.8 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  28.85 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  27.42 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  31.17 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  30.97 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  25.71 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  25.71 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  28.21 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  27.45 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  29.04 
 
 		 302 aa  96.3  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  27.65 
 
 		 293 aa  92.4  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  36.59 
 
 		 374 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  27.88 
 
 		 307 aa  86.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  27.48 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  28.57 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  27.48 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  32.76 
 
 		 493 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  27.54 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  30.29 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  38.17 
 
 		 349 aa  79  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  26.38 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  22.15 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  32.08 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  37.12 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  24.15 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  27.48 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  27.52 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  25.17 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  25.17 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  25.17 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  38.05 
 
 		 421 aa  65.9  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  35.65 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  34.92 
 
 		 128 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  31.3 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  24.72 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  39.39 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  37.72 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  29.37 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  37 
 
 		 359 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  38.05 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  35.43 
 
 		 493 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  33.12 
 
 		 287 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  24.88 
 
 		 222 aa  52.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  33.64 
 
 		 585 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  35.77 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  31.15 
 
 		 326 aa  49.7  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  29.87 
 
 		 333 aa  49.3  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0449  restriction endonuclease  33.86 
 
 		 250 aa  49.3  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.679724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  28.83 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  30.97 
 
 		 454 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  29.22 
 
 		 348 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  35.59 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  31.09 
 
 		 184 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  36.52 
 
 		 310 aa  46.2  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  30.2 
 
 		 440 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  35.34 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9871  hypothetical protein  29.33 
 
 		 187 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  28.79 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  29.2 
 
 		 454 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  30.2 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  27.61 
 
 		 447 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4180  restriction endonuclease  25.44 
 
 		 196 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  36.44 
 
 		 355 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  29.2 
 
 		 454 aa  43.5  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  28.41 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  31.63 
 
 		 342 aa  43.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  32.71 
 
 		 230 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  34.78 
 
 		 799 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  34.78 
 
 		 799 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  33.64 
 
 		 271 aa  42.4  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>