More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0511 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0511  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 
521 aa  1023    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0671541  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.23 
 
 
549 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37840  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  40.9 
 
 
527 aa  241  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.183307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1396  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.79 
 
 
556 aa  237  4e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0792453  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0597  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.87 
 
 
524 aa  233  6e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3624  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  40.2 
 
 
534 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5077  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  39.09 
 
 
558 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.669392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1041  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.94 
 
 
563 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.86 
 
 
583 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3869  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.82 
 
 
540 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0780654  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0516  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  43.6 
 
 
551 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.494756  normal  0.0577704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  40.41 
 
 
538 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3238  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.76 
 
 
539 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.698752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3300  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.76 
 
 
539 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.814205  hitchhiker  0.00983464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2258  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  42.24 
 
 
542 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0498367  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3249  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.47 
 
 
539 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710576  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3705  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.07 
 
 
527 aa  190  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4414  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  39.76 
 
 
558 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3503  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.13 
 
 
546 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.243231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3003  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.62 
 
 
503 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0343689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4697  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.78 
 
 
527 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269439  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25730  PAS domain S-box  41.8 
 
 
520 aa  181  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1162  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  41.73 
 
 
528 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.308176  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1004  sensor histidine kinase  30.04 
 
 
529 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.68776e-61 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4399  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.22 
 
 
525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262296  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4177  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.46 
 
 
525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0530735  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4243  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.46 
 
 
525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0209492  normal  0.158943 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4346  sensor histidine kinase  29.37 
 
 
529 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149156  hitchhiker  0.000000000000186115 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0496  sensory histidine kinase DcuS  30.72 
 
 
528 aa  169  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1009  sensor histidine kinase  28.71 
 
 
529 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0965  sensor histidine kinase  28.32 
 
 
529 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1089  sensor histidine kinase  28.52 
 
 
529 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0869  sensor histidine kinase  28.12 
 
 
529 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0923  sensor histidine kinase  28.12 
 
 
529 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0811  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.18 
 
 
529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1529  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  39.35 
 
 
543 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0837  sensor histidine kinase  27.56 
 
 
529 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  40.88 
 
 
529 aa  164  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633378  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3991  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.62 
 
 
553 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00164194  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4725  sensory histidine kinase DcuS  30.63 
 
 
534 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.678206  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0614  sensory histidine kinase DcuS  29.78 
 
 
534 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0700  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.38 
 
 
543 aa  161  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0639  sensory histidine kinase DcuS  30 
 
 
534 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3596  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  39.18 
 
 
519 aa  159  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2555  sensory histidine kinase DcuS  30.75 
 
 
538 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.129089 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0489  sensory histidine kinase DcuS  29.72 
 
 
534 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2036  ATP-binding region ATPase domain protein  38.06 
 
 
536 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0487  sensory histidine kinase DcuS  29.41 
 
 
534 aa  156  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0632  sensory histidine kinase DcuS  29.41 
 
 
534 aa  156  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0545  sensory histidine kinase DcuS  30 
 
 
534 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.847766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0576  sensory histidine kinase DcuS  30 
 
 
534 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0490  sensory histidine kinase DcuS  29.69 
 
 
534 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0515  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.23 
 
 
526 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1377  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.91 
 
 
525 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1529  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.14 
 
 
569 aa  150  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000208522 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2898  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.29 
 
 
553 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0044  sensory histidine kinase DcuS  30.09 
 
 
542 aa  147  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4311  sensory histidine kinase DcuS  29.52 
 
 
533 aa  146  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412968  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0038  sensory histidine kinase DcuS  28.77 
 
 
542 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4102  sensory histidine kinase DcuS  29.11 
 
 
537 aa  145  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2789  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.82 
 
 
536 aa  144  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3378  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.63 
 
 
545 aa  141  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.960766  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3910  sensory histidine kinase DcuS  27.67 
 
 
537 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1959  sensory histidine kinase DcuS  28.53 
 
 
533 aa  140  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516955 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2441  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.23 
 
 
540 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1347  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.88 
 
 
575 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638026 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1350  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  40.19 
 
 
543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0318  sensor kinase citA  29.36 
 
 
565 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1304  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.88 
 
 
591 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0304206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1240  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.14 
 
 
541 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000276458  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3867  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.51 
 
 
543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003319  sensor kinase CitA  29.86 
 
 
539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5639  sensory histidine kinase DcuS  27.51 
 
 
543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0834  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.79 
 
 
540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0952704  normal  0.0982471 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4592  sensory histidine kinase DcuS  27.51 
 
 
543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3902  sensory histidine kinase DcuS  27.51 
 
 
543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4679  sensory histidine kinase DcuS  25.14 
 
 
543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4366  sensory histidine kinase DcuS  25.14 
 
 
543 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.206477  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02431  sensor kinase CitA  29.81 
 
 
541 aa  127  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0527  sensor histidine kinase  26.57 
 
 
536 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0559  sensor histidine kinase  26.57 
 
 
536 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0615  sensor histidine kinase  26.57 
 
 
534 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0470  sensor histidine kinase  26.18 
 
 
536 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.974367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0595  sensor protein CitS  26.23 
 
 
533 aa  124  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4650  sensory histidine kinase DcuS  25.28 
 
 
543 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4699  sensory histidine kinase DcuS  27.49 
 
 
543 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3731  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.43 
 
 
532 aa  123  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.95506  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4650  sensory histidine kinase DcuS  25.28 
 
 
543 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.414572  normal  0.461897 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0620  sensor histidine kinase  26.67 
 
 
536 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4645  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.45 
 
 
529 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0470  sensor histidine kinase  26.57 
 
 
536 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0688  sensor histidine kinase  26.18 
 
 
534 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4559  sensory histidine kinase DcuS  27.49 
 
 
543 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4567  sensory histidine kinase DcuS  24.91 
 
 
543 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4744  sensor protein CitS  26.51 
 
 
533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0472  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.62 
 
 
532 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3432  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.62 
 
 
537 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1749  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29 
 
 
534 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000244457  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0928  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.41 
 
 
537 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0938  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.41 
 
 
537 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.101589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>