More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0472 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 459 aa  907    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.55 
 
 		 475 aa  362  9e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  42.15 
 
 		 467 aa  357  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.91 
 
 		 476 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.54 
 
 		 483 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.58 
 
 		 469 aa  345  1e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.39 
 
 		 462 aa  344  2e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.47 
 
 		 490 aa  342  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.37 
 
 		 491 aa  340  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.96 
 
 		 460 aa  339  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44 
 
 		 460 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  43.93 
 
 		 480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  43.71 
 
 		 480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  42.86 
 
 		 475 aa  336  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.37 
 
 		 479 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  40.25 
 
 		 481 aa  334  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.6 
 
 		 497 aa  334  2e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.74 
 
 		 481 aa  333  3e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.6 
 
 		 462 aa  333  3e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.25 
 
 		 459 aa  333  4e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.75 
 
 		 464 aa  332  9e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.15 
 
 		 479 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  43.15 
 
 		 479 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  43.14 
 
 		 460 aa  330  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.16 
 
 		 480 aa  330  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.83 
 
 		 460 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.19 
 
 		 482 aa  329  8e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.92 
 
 		 479 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  42.05 
 
 		 460 aa  328  9e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  44.49 
 
 		 480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.76 
 
 		 479 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  42.7 
 
 		 481 aa  324  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.92 
 
 		 480 aa  325  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4510  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.83 
 
 		 476 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal  0.913937 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.82 
 
 		 480 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.312145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  41.67 
 
 		 481 aa  322  9.000000000000001e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  40.95 
 
 		 477 aa  322  9.000000000000001e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  43.15 
 
 		 479 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  41.47 
 
 		 490 aa  319  6e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.26 
 
 		 486 aa  319  6e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  37.28 
 
 		 461 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.22 
 
 		 462 aa  317  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  43.37 
 
 		 480 aa  318  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0613  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.03 
 
 		 473 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  40.73 
 
 		 477 aa  318  2e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  37.28 
 
 		 461 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.65 
 
 		 462 aa  317  4e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0512  putative modulator of DNA gyrase  40.86 
 
 		 490 aa  316  5e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  41.08 
 
 		 484 aa  316  6e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.62 
 
 		 470 aa  315  8e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.08 
 
 		 493 aa  315  8e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  38.65 
 
 		 480 aa  315  9e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  43.3 
 
 		 481 aa  315  9e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  44.17 
 
 		 480 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  41.39 
 
 		 483 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  38.43 
 
 		 480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  41.7 
 
 		 486 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.61 
 
 		 465 aa  313  4.999999999999999e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.96 
 
 		 490 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.87 
 
 		 464 aa  312  9e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4322  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.98 
 
 		 479 aa  312  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.74 
 
 		 482 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.74 
 
 		 482 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2956  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.35 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  41.57 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.74 
 
 		 482 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.76 
 
 		 487 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.27 
 
 		 464 aa  311  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0939  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.38 
 
 		 487 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.96 
 
 		 482 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0473  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.9 
 
 		 473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1825  microcin-processing peptidase 2  40.9 
 
 		 473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3972  microcin-processing peptidase 2  40.94 
 
 		 488 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0726  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.51 
 
 		 488 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.571248 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2490  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.47 
 
 		 487 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.71 
 
 		 470 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.52 
 
 		 482 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0876014  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4091  tldD protein  42.19 
 
 		 482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.7 
 
 		 462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  41.87 
 
 		 481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.18 
 
 		 490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0599  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.16 
 
 		 471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0472  TldD protein  40.89 
 
 		 485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0623925  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.13 
 
 		 508 aa  307  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.8 
 
 		 488 aa  307  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.62 
 
 		 482 aa  307  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  41.52 
 
 		 482 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0412  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.89 
 
 		 485 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.140999  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.29 
 
 		 482 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0640  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.96 
 
 		 471 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.481365 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  41.27 
 
 		 473 aa  305  8.000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  39.38 
 
 		 470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0991  microcin-processing peptidase 2  41.13 
 
 		 486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  42.19 
 
 		 497 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0505  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40 
 
 		 471 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.279079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.02 
 
 		 496 aa  304  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  40.77 
 
 		 481 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  39.38 
 
 		 470 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.77 
 
 		 477 aa  303  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1296  tldD protein  41.1 
 
 		 482 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.576694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>