54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0454 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  39.53 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  37.69 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  41.44 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  34.87 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  33.46 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  35.34 
 
 		 264 aa  132  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  30.95 
 
 		 257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  33.98 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  32.94 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  30.16 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  35.27 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  30.95 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  29.25 
 
 		 265 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  35.19 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  34.6 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  34.6 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  31.09 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  32.96 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  34.6 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  31.13 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  29.96 
 
 		 291 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  28.85 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  30.19 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  29.12 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  28.46 
 
 		 271 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  28.74 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  27.86 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  29.81 
 
 		 268 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  29.81 
 
 		 268 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  29.81 
 
 		 268 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  28.57 
 
 		 263 aa  95.5  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  29.75 
 
 		 276 aa  93.2  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  28.05 
 
 		 270 aa  89  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  28.68 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  27.34 
 
 		 254 aa  85.9  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  26.34 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2774  hypothetical protein  31.4 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  27.05 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  26.07 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  24.81 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  28.03 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  27.92 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  25.38 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  24.63 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  27.47 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  27.48 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  30.68 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  30.68 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  30.68 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  27.27 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  25.3 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  25.82 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  25.82 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>