More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0424 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0424  ribosomal protein S11  100 
 
 		 132 aa  265  2e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  70.73 
 
 		 131 aa  186  9e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  68.6 
 
 		 131 aa  184  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 		 129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 		 129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 		 129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  65.85 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  67.48 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  65.85 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  67.48 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  67.48 
 
 		 129 aa  178  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  71.3 
 
 		 131 aa  178  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  65.62 
 
 		 130 aa  178  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 130 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 129 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 129 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  71.9 
 
 		 130 aa  177  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  64.8 
 
 		 131 aa  177  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  71.54 
 
 		 133 aa  176  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  68.7 
 
 		 131 aa  175  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  70.43 
 
 		 131 aa  175  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  64.39 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  67.83 
 
 		 130 aa  175  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  64.39 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  64.39 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  65.04 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  65.04 
 
 		 129 aa  174  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 129 aa  174  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  72.73 
 
 		 134 aa  174  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  67.65 
 
 		 136 aa  174  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  67.15 
 
 		 137 aa  174  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  63.41 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  60.61 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1111  30S ribosomal protein S11  70.4 
 
 		 138 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  63.71 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1140  30S ribosomal protein S11  70.4 
 
 		 138 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1732  30S ribosomal protein S11  65.91 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1128  30S ribosomal protein S11  70.4 
 
 		 138 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0498  ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 126 aa  172  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.423848  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  68.25 
 
 		 134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 128 aa  171  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  67.24 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  63.41 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  64.23 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3877  30S ribosomal protein S11  64.89 
 
 		 135 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5047  30S ribosomal protein S11  63.71 
 
 		 134 aa  171  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4481  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 135 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  71.54 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  65.32 
 
 		 134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13496  30S ribosomal protein S11  70.4 
 
 		 139 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2344e-17  normal  0.330141 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  64.52 
 
 		 129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  61.24 
 
 		 133 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119474 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  66.38 
 
 		 129 aa  170  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  60.61 
 
 		 129 aa  170  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  66.38 
 
 		 129 aa  170  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4219  30S ribosomal protein S11  63.71 
 
 		 134 aa  170  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815037  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  61.36 
 
 		 129 aa  170  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0343  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 134 aa  170  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  hitchhiker  0.000136373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  63.71 
 
 		 134 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0499  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 134 aa  170  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  63.71 
 
 		 134 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  63.71 
 
 		 134 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0396  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 134 aa  169  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0404  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 134 aa  169  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  62.12 
 
 		 129 aa  169  7.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 133 aa  169  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 133 aa  169  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 133 aa  169  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 133 aa  169  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 133 aa  169  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 133 aa  169  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 133 aa  169  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 133 aa  169  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 133 aa  169  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 133 aa  169  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 133 aa  169  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 133 aa  169  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 133 aa  169  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 133 aa  169  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 133 aa  169  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0649  ribosomal protein S11  60.61 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  60.61 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5057  30S ribosomal protein S11  60.61 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518123  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0624  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 134 aa  169  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1045  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 134 aa  169  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1215  30S ribosomal protein S11  70.45 
 
 		 132 aa  169  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0134437 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  59.38 
 
 		 130 aa  168  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  66.38 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0276  30S ribosomal protein S11  64.39 
 
 		 132 aa  168  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3384  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 137 aa  167  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2303  30S ribosomal protein S11  61.29 
 
 		 134 aa  167  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  59.85 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  59.85 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 135 aa  167  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  59.85 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0332  30S ribosomal protein S11  67.69 
 
 		 135 aa  167  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.147865  hitchhiker  0.000897065 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  66.13 
 
 		 139 aa  166  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  59.09 
 
 		 129 aa  166  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>