196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0406 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0406  ribosomal protein L29  100 
 
 		 78 aa  141  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  46.88 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  46.15 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  46.88 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  46.88 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  48.28 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  51.85 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  50.91 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1348  ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  40.98 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  40.98 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  45.61 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  40.98 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  52.46 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  36.51 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 		 66 aa  50.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  42.62 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  42.62 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  44.26 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1938  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  49.15 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  52.63 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  52.63 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  40.38 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  52.63 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  44.23 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  54.39 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  40.38 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0709  ribosomal protein L29  52.46 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196069  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  50.88 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  42.59 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1859  50S ribosomal protein L29  41.82 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0881422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  56.36 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  52.73 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2611  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000175569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  56.36 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  56.36 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1916  ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174298  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  54.55 
 
 		 77 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0413  50S ribosomal protein L29P  47.46 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000118105  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4741  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0297311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  35 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0492  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.27234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  36.21 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Maur_5050  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0326432  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0345  ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 71 aa  47.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  52.63 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  50.88 
 
 		 85 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  44.62 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  45.1 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2766  ribosomal protein L29  40 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105507  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  37.93 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  42.31 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  46.43 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  52.73 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06330  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.674769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08930  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0335078 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3135  ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0727  ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000905771  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  48.39 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0845  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4540  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.115011 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>