More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0388 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  100 
 
 		 241 aa  474  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  61.7 
 
 		 236 aa  310  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  62.39 
 
 		 235 aa  308  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  62.34 
 
 		 235 aa  306  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  63.48 
 
 		 242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  63.72 
 
 		 231 aa  304  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  60.26 
 
 		 238 aa  298  7e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  60.09 
 
 		 235 aa  296  2e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 238 aa  296  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  58.37 
 
 		 235 aa  291  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  57.64 
 
 		 259 aa  291  6e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  66.52 
 
 		 232 aa  291  8e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  59.65 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  58.08 
 
 		 236 aa  290  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  59.47 
 
 		 238 aa  290  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  60.17 
 
 		 233 aa  288  7e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  59.29 
 
 		 233 aa  286  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  60.53 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  57.26 
 
 		 239 aa  284  9e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  59.73 
 
 		 230 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  57.08 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0539  50S ribosomal protein L1  61.7 
 
 		 237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  56.36 
 
 		 237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  58.48 
 
 		 225 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  59.21 
 
 		 232 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  56.65 
 
 		 233 aa  281  7.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6639  50S ribosomal protein L1  60 
 
 		 238 aa  281  9e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  59.03 
 
 		 231 aa  280  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  58.77 
 
 		 235 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  59.19 
 
 		 231 aa  280  1e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  58.04 
 
 		 236 aa  280  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  58.77 
 
 		 235 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  58.04 
 
 		 238 aa  280  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  58.77 
 
 		 235 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  60.35 
 
 		 229 aa  279  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  58.48 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0296  50S ribosomal protein L1P  61.14 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  57.14 
 
 		 233 aa  275  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  59.28 
 
 		 234 aa  275  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  58.77 
 
 		 242 aa  275  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  58.04 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1070  50S ribosomal protein L1  59.32 
 
 		 237 aa  275  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  63.93 
 
 		 230 aa  274  8e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  58.74 
 
 		 234 aa  274  9e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  60.44 
 
 		 229 aa  273  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  60.44 
 
 		 229 aa  273  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03650  50S ribosomal protein L1  60.53 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  57.59 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  55.02 
 
 		 231 aa  272  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 238 aa  272  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6060  50S ribosomal protein L1  59.83 
 
 		 237 aa  271  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0743  ribosomal protein L1  56.41 
 
 		 237 aa  271  5.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  55.95 
 
 		 233 aa  271  7e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  58.41 
 
 		 238 aa  271  9e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  57.02 
 
 		 235 aa  270  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0570  50S ribosomal protein L1  57.64 
 
 		 259 aa  269  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 232 aa  268  4e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  59.24 
 
 		 234 aa  268  5e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 234 aa  268  5e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  59.24 
 
 		 234 aa  268  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  54.74 
 
 		 235 aa  268  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  59.24 
 
 		 234 aa  268  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  56.33 
 
 		 231 aa  267  8.999999999999999e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5115  50S ribosomal protein L1  58.8 
 
 		 239 aa  267  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  56.25 
 
 		 230 aa  267  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  57.34 
 
 		 234 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  54.31 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  58.08 
 
 		 230 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1015  ribosomal protein L1  59.11 
 
 		 237 aa  265  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  58.59 
 
 		 230 aa  265  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 233 aa  265  5e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  59.03 
 
 		 230 aa  265  7e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  59.03 
 
 		 230 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  59.03 
 
 		 230 aa  265  7e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  59.03 
 
 		 230 aa  265  7e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  59.03 
 
 		 230 aa  265  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  59.03 
 
 		 230 aa  265  7e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  59.03 
 
 		 230 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  54.19 
 
 		 233 aa  264  1e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  54.19 
 
 		 233 aa  264  1e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  54.19 
 
 		 233 aa  264  1e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  56.52 
 
 		 233 aa  263  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1763  50S ribosomal protein L1  54.39 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00323247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1739  50S ribosomal protein L1  54.39 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02321  50S ribosomal protein L1  52.11 
 
 		 235 aa  262  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1113  ribosomal protein L1  58.8 
 
 		 238 aa  263  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  58.15 
 
 		 230 aa  263  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  55.51 
 
 		 230 aa  262  3e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10654  50S ribosomal protein L1  57.46 
 
 		 235 aa  262  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0559095 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  58.15 
 
 		 230 aa  262  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  56.09 
 
 		 233 aa  262  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  56.5 
 
 		 232 aa  262  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  54.71 
 
 		 229 aa  261  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  53.51 
 
 		 230 aa  261  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  53.51 
 
 		 230 aa  261  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1019  50S ribosomal protein L1  53.51 
 
 		 238 aa  261  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726287 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  57.71 
 
 		 230 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  55.16 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 237 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>