More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0386 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  100 
 
 		 243 aa  494  1e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  51.52 
 
 		 273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  48.67 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  56.04 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  53.12 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  53.33 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  54.75 
 
 		 266 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  53.8 
 
 		 306 aa  205  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  46.12 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  53.97 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  41.79 
 
 		 276 aa  202  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  51.61 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  54.55 
 
 		 176 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  49.48 
 
 		 271 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  43.35 
 
 		 273 aa  198  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  48.97 
 
 		 270 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  48.97 
 
 		 270 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  48.72 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  53.67 
 
 		 176 aa  197  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  52.63 
 
 		 280 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  53.11 
 
 		 181 aa  196  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  49.25 
 
 		 242 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  52.2 
 
 		 242 aa  195  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  52.54 
 
 		 178 aa  194  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  48.98 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  45.06 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  50.57 
 
 		 175 aa  193  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  48.63 
 
 		 273 aa  191  6e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  50.85 
 
 		 178 aa  191  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  46.77 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  51.43 
 
 		 175 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  48.42 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  52 
 
 		 181 aa  187  9e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  48 
 
 		 175 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  49.55 
 
 		 228 aa  184  8e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  50 
 
 		 201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  48.31 
 
 		 177 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  50 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  43.12 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  47.43 
 
 		 194 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2995  NusG antitermination factor  46.99 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  45.26 
 
 		 194 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  46.33 
 
 		 203 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  48.02 
 
 		 174 aa  179  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0909  NusG antitermination factor  50.28 
 
 		 262 aa  178  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269153  normal  0.196956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2707  NusG antitermination factor  46.74 
 
 		 267 aa  178  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0675  NusG antitermination factor  50.52 
 
 		 320 aa  178  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5965  NusG antitermination factor  46.67 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.981962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  49.72 
 
 		 177 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  42.86 
 
 		 317 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21030  transcription antitermination protein nusG  41.67 
 
 		 296 aa  174  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0843287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  48.86 
 
 		 175 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  47.73 
 
 		 172 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  49.44 
 
 		 177 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  47.43 
 
 		 173 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  46.29 
 
 		 187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  46.2 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  48.86 
 
 		 175 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  46.59 
 
 		 176 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  47.75 
 
 		 182 aa  171  9e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  45.11 
 
 		 199 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  47.46 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  47.85 
 
 		 185 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  48.31 
 
 		 182 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  48.31 
 
 		 182 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1532  NusG antitermination factor  46.67 
 
 		 174 aa  169  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  46.33 
 
 		 177 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  47.75 
 
 		 177 aa  169  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  45.56 
 
 		 178 aa  169  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  48.57 
 
 		 177 aa  169  5e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  48.57 
 
 		 177 aa  168  6e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  48.57 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  46.89 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  45.45 
 
 		 185 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  46.33 
 
 		 177 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  45.31 
 
 		 188 aa  165  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  43.96 
 
 		 174 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  45.45 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  45.45 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  45.45 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  45.45 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  45.45 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  45.45 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  45.45 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2677  NusG antitermination factor  45.89 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  45.14 
 
 		 178 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17300  transcription termination/antitermination factor NusG  41.92 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  45.76 
 
 		 177 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  43.48 
 
 		 203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  45.76 
 
 		 177 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  45.2 
 
 		 177 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  45.2 
 
 		 177 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  45.76 
 
 		 177 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  45.76 
 
 		 177 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  47.62 
 
 		 181 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  45.76 
 
 		 177 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  45.2 
 
 		 177 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  45.76 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  45.14 
 
 		 173 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  45.14 
 
 		 173 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>