127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0378 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0378  protein of unknown function DUF470  100 
 
 		 938 aa  1823    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173445  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 1118 aa  197  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  38.44 
 
 		 578 aa  188  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 		 1132 aa  175  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  31.48 
 
 		 701 aa  167  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 1094 aa  166  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  31.49 
 
 		 592 aa  164  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 1113 aa  164  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 		 1101 aa  162  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  32.82 
 
 		 1098 aa  162  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 1100 aa  157  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  31.07 
 
 		 1172 aa  156  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0206  hypothetical protein  32.54 
 
 		 599 aa  154  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.914985  normal  0.140787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 1112 aa  153  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 1112 aa  153  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 		 1111 aa  150  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1547  hypothetical protein  35.54 
 
 		 656 aa  147  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.736781  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 		 1100 aa  146  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  30.21 
 
 		 1147 aa  145  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7583  protein of unknown function DUF470  32.68 
 
 		 597 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 1120 aa  143  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  27.92 
 
 		 917 aa  139  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2745  hypothetical protein  30.85 
 
 		 643 aa  139  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 		 1138 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  25.41 
 
 		 556 aa  126  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.76 
 
 		 859 aa  119  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.33 
 
 		 859 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  23.65 
 
 		 861 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  23.65 
 
 		 861 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  23.65 
 
 		 861 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  23.65 
 
 		 861 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  22.73 
 
 		 862 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  25.04 
 
 		 556 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  28.49 
 
 		 854 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  25.04 
 
 		 556 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  23.65 
 
 		 861 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  23.85 
 
 		 861 aa  116  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  23.46 
 
 		 861 aa  115  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  23.36 
 
 		 861 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  22.38 
 
 		 858 aa  105  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  21.65 
 
 		 875 aa  105  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11635  hypothetical protein  27.33 
 
 		 484 aa  105  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  30.61 
 
 		 854 aa  104  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  20.88 
 
 		 813 aa  102  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  28.57 
 
 		 429 aa  101  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  26.43 
 
 		 863 aa  100  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  26.43 
 
 		 863 aa  99.8  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  28.91 
 
 		 568 aa  97.8  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  24.63 
 
 		 861 aa  95.1  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  22.3 
 
 		 569 aa  93.2  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  29.57 
 
 		 866 aa  90.9  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  34.98 
 
 		 876 aa  90.9  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  25.97 
 
 		 723 aa  90.5  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  26.88 
 
 		 395 aa  90.5  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  25.3 
 
 		 839 aa  90.1  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  27.22 
 
 		 880 aa  89  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  27.04 
 
 		 880 aa  87.8  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  31.46 
 
 		 881 aa  87.8  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  31.72 
 
 		 881 aa  87.8  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  27.34 
 
 		 867 aa  86.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  22.18 
 
 		 851 aa  85.5  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  26.99 
 
 		 867 aa  85.5  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  25.05 
 
 		 870 aa  85.1  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  32.22 
 
 		 879 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  29.64 
 
 		 883 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  27.11 
 
 		 875 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  26.24 
 
 		 869 aa  83.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  26.35 
 
 		 850 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  24.79 
 
 		 905 aa  82.8  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  25.42 
 
 		 850 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  25.77 
 
 		 850 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  25.42 
 
 		 850 aa  82  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  28.99 
 
 		 872 aa  81.6  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  30.1 
 
 		 880 aa  81.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  22.99 
 
 		 847 aa  81.6  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  30.1 
 
 		 880 aa  81.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  30.1 
 
 		 880 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  25.79 
 
 		 850 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  25.96 
 
 		 850 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  29.64 
 
 		 880 aa  79.7  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  28.1 
 
 		 877 aa  78.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  28.1 
 
 		 877 aa  78.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  25.96 
 
 		 850 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  25.57 
 
 		 844 aa  77.4  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  25.1 
 
 		 590 aa  77.4  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2334  protein of unknown function DUF470  29.29 
 
 		 844 aa  77.4  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  22.65 
 
 		 840 aa  77  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3572  protein of unknown function DUF470  25.15 
 
 		 346 aa  76.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  28.33 
 
 		 855 aa  74.3  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  24.14 
 
 		 861 aa  73.9  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  26.16 
 
 		 850 aa  74.3  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  20.89 
 
 		 851 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  20.89 
 
 		 851 aa  71.6  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  25.93 
 
 		 896 aa  71.2  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  25.23 
 
 		 877 aa  71.2  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1364  hypothetical protein  26.69 
 
 		 857 aa  68.9  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  26.64 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  24.29 
 
 		 852 aa  68.2  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  26.61 
 
 		 557 aa  68.2  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  29.03 
 
 		 844 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>