19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0329 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0329  Formiminotransferase domain protein  100 
 
 
268 aa  518  1e-146  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0694  glutamate formiminotransferase  40.41 
 
 
518 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0241  glutamate formiminotransferase  34.46 
 
 
299 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.161753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0390  glutamate formiminotransferase  35.16 
 
 
298 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.767413  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1173  glutamate formiminotransferase  33.11 
 
 
301 aa  142  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0263  glutamate formiminotransferase  35.25 
 
 
495 aa  141  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0569087  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0808  glutamate formiminotransferase  32.09 
 
 
303 aa  139  4.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2818  glutamate formiminotransferase  33.11 
 
 
297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0915  glutamate formiminotransferase  33.89 
 
 
306 aa  135  9e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0084  glutamate formiminotransferase  34.35 
 
 
304 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0296  formiminotransferase, putative  33.22 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0468401  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0084  glutamate formiminotransferase  34.35 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014964  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2130  formiminotransferase-like  35.34 
 
 
490 aa  131  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0329  formiminotransferase-cyclodeaminase-related protein  33.22 
 
 
300 aa  125  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0528  glutamate formiminotransferase  29.04 
 
 
319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000113246  normal  0.11783 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1135  glutamate formiminotransferase  31.91 
 
 
555 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000259237  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1367  glutamate formimidoyltransferase  23.66 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3011  Formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  37.08 
 
 
302 aa  75.5  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.509164  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88189  predicted protein  30.71 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0324672  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>