More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0298 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0298  NLP/P60 protein  100 
 
 		 437 aa  844    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  48.51 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  50 
 
 		 327 aa  103  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  45.69 
 
 		 281 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.88 
 
 		 531 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  47.27 
 
 		 337 aa  96.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  47.83 
 
 		 350 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  43.88 
 
 		 333 aa  94  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  48.98 
 
 		 459 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0041  NLP/P60  41.32 
 
 		 331 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  41.23 
 
 		 337 aa  90.5  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  32.74 
 
 		 306 aa  90.5  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  46.6 
 
 		 315 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5763  NLP/P60 protein  59.74 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  40.44 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  40.8 
 
 		 372 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  39.45 
 
 		 329 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  40.8 
 
 		 372 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43 
 
 		 321 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  44.9 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  37.8 
 
 		 360 aa  87.8  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  40 
 
 		 372 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 335 aa  87  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  43.43 
 
 		 378 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  36.67 
 
 		 331 aa  86.7  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  40.68 
 
 		 349 aa  86.3  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.19 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.69 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  32.24 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  44.14 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  41.75 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  51.28 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  43.69 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  46.39 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  40.91 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  43 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.96 
 
 		 438 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  40.91 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.32 
 
 		 329 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  45.1 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  39 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  34.22 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  36.84 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  42.45 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4630  NLP/P60 protein  39.23 
 
 		 162 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  40.57 
 
 		 381 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  42.2 
 
 		 452 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  40.2 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  40.59 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.35 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.69 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  38.98 
 
 		 162 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0245  hypothetical protein  36.47 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.192435  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  38.52 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  41.74 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  35.61 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  38.58 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  38.78 
 
 		 502 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  39.62 
 
 		 319 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8932  NLP/P60 protein  35.94 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00108547  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  48 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  35.04 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  35.04 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  33.55 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38.78 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  34.78 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  39.8 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  38.14 
 
 		 222 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  40 
 
 		 333 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  36.17 
 
 		 491 aa  72.4  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.38 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  39.23 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  37.07 
 
 		 257 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  36.75 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  43.68 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0796  NLP/P60 protein  37.89 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  40 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  37.23 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  38.39 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  38.37 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  41.41 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  36 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  40.45 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0007  NLP/P60 family protein  37.9 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  42.27 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>