More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0261 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
390 aa  780    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4698  acetyl-CoA acetyltransferase  59.25 
 
 
396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3121  acetyl-CoA acetyltransferase  56.4 
 
 
406 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000096812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0929  acetyl-CoA acetyltransferase  55.91 
 
 
406 aa  424  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.561764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8569  Acetyl-CoA C-acyltransferase  54.43 
 
 
406 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1472  acetyl-CoA acetyltransferase  55.06 
 
 
406 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0328581  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1828  acetyl-CoA acetyltransferase  55.31 
 
 
406 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.901012  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0436  acetyl-CoA acetyltransferase  55.06 
 
 
407 aa  413  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0081  acetyl-CoA acetyltransferase  54.46 
 
 
406 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11092  acetyl-CoA acetyltransferase  54.17 
 
 
405 aa  413  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.641884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0639  acetyl-CoA acetyltransferase  52.84 
 
 
405 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2347  acetyl-CoA acetyltransferase  56.68 
 
 
404 aa  408  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000971024  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0908  acetyl-CoA acetyltransferase  51.91 
 
 
420 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31900  acetyl-CoA acetyltransferase  52.59 
 
 
406 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213543  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4383  acetyl-CoA acetyltransferase  54.21 
 
 
405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0851  acetyl-CoA acetyltransferase  52.28 
 
 
420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.194541 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07120  acetyl-CoA acetyltransferase  53.2 
 
 
407 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.69838  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4152  acetyl-CoA acetyltransferase  54.21 
 
 
405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4227  acetyl-CoA acetyltransferase  54.21 
 
 
405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117712  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  54.52 
 
 
406 aa  403  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2040  acetyl-CoA acetyltransferase  52.97 
 
 
405 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.239863  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4677  acetyl-CoA acetyltransferase  53.33 
 
 
405 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0699  acetyl-CoA acetyltransferase  54.19 
 
 
406 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1615  acetyl-CoA acetyltransferase  52.46 
 
 
415 aa  398  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.690139  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30280  acetyl-CoA acetyltransferase  54.93 
 
 
405 aa  397  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  53.38 
 
 
414 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.711113  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  53.4 
 
 
412 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1371  acetyl-CoA acetyltransferase  52.48 
 
 
404 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0816349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4616  acetyl-CoA acetyltransferase  53.04 
 
 
412 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1045  acetyl-CoA acetyltransferase  51.97 
 
 
406 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  50.61 
 
 
398 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  50.37 
 
 
398 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  48.08 
 
 
395 aa  347  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  50.12 
 
 
399 aa  344  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0625  acetyl-CoA acetyltransferase  48.44 
 
 
378 aa  341  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  47.1 
 
 
390 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  46.6 
 
 
390 aa  338  9e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.86 
 
 
391 aa  336  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  46.08 
 
 
400 aa  336  3.9999999999999995e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  48.57 
 
 
391 aa  334  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  48.48 
 
 
396 aa  334  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  47.95 
 
 
388 aa  333  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  48.39 
 
 
403 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.25 
 
 
401 aa  330  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  46.87 
 
 
398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.21 
 
 
391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  46.65 
 
 
402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  46.68 
 
 
424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.73 
 
 
390 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  47.5 
 
 
392 aa  327  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  47.93 
 
 
391 aa  327  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  47.41 
 
 
400 aa  327  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  45.13 
 
 
384 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  49 
 
 
401 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  49.24 
 
 
390 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  48.73 
 
 
390 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0225  acetyl-CoA acetyltransferase  45.48 
 
 
395 aa  325  1e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.13 
 
 
404 aa  323  5e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.32 
 
 
401 aa  322  8e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  45.91 
 
 
404 aa  322  9.000000000000001e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  44.97 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  44.97 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  44.72 
 
 
390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  44.72 
 
 
390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  44.72 
 
 
390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  44.72 
 
 
390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.52 
 
 
400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  44.72 
 
 
390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  44.84 
 
 
394 aa  320  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.88 
 
 
402 aa  320  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  44.72 
 
 
390 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.25 
 
 
400 aa  319  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  44.72 
 
 
390 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4336  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.88 
 
 
402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  44.72 
 
 
390 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.75 
 
 
403 aa  319  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.08 
 
 
401 aa  319  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  46.38 
 
 
401 aa  319  6e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  44.72 
 
 
390 aa  318  7e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.56 
 
 
387 aa  319  7e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.78 
 
 
401 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.78 
 
 
401 aa  318  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.78 
 
 
401 aa  318  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.78 
 
 
401 aa  317  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1310  Acetyl-CoA C-acyltransferase  47.4 
 
 
380 aa  317  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  45.24 
 
 
386 aa  317  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.56 
 
 
387 aa  316  5e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3039  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.89 
 
 
400 aa  316  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.31 
 
 
387 aa  315  6e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.06 
 
 
387 aa  315  7e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.31 
 
 
387 aa  315  8e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.31 
 
 
387 aa  315  8e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.31 
 
 
387 aa  315  9e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.31 
 
 
387 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.31 
 
 
387 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.31 
 
 
387 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.44 
 
 
401 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.31 
 
 
387 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3064  acetyl-CoA acetyltransferase  45.71 
 
 
392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5109  acetyl-CoA acetyltransferase  44.36 
 
 
392 aa  313  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>