More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0240 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0240  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
120 aa  241  3e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.6 
 
 
121 aa  110  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.28 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.28 
 
 
110 aa  108  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0952421  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2408  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.5 
 
 
120 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00136541  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0036  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50.46 
 
 
126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0044  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50.46 
 
 
126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.709192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.11 
 
 
121 aa  107  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.54 
 
 
116 aa  107  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3536  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.35 
 
 
120 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0677815  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  49.53 
 
 
108 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0156  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
113 aa  104  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0047  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50 
 
 
109 aa  105  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  49.53 
 
 
130 aa  104  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1285  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.67 
 
 
117 aa  104  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.257084 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0954  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.43 
 
 
133 aa  104  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.557942  normal  0.360876 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  43.1 
 
 
141 aa  103  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1041  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.23 
 
 
117 aa  103  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1830  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.55 
 
 
128 aa  103  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0867  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.11 
 
 
118 aa  103  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0569822  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50 
 
 
116 aa  103  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1763  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.55 
 
 
128 aa  103  9e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.910662  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0403  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.71 
 
 
126 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0292839  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1797  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.65 
 
 
120 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.654159  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3067  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.3 
 
 
124 aa  102  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1012  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.06 
 
 
115 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.59 
 
 
147 aa  102  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000130443  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  48.62 
 
 
117 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  45.28 
 
 
113 aa  102  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2673  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.3 
 
 
124 aa  102  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.407171  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1561  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
108 aa  102  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.571955 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  43.75 
 
 
113 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.38 
 
 
127 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0435  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.92 
 
 
122 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.0210981 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2185  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.15 
 
 
123 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3154  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
115 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.889922  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.75 
 
 
130 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.38 
 
 
127 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  46.79 
 
 
127 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3448  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.65 
 
 
121 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0379124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2642  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.54 
 
 
121 aa  101  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0615003  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3150  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
108 aa  101  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.654689  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4109  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.06 
 
 
121 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
120 aa  100  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.04 
 
 
110 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1567  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.11 
 
 
125 aa  100  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.679568 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4049  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.65 
 
 
121 aa  100  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0629  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.06 
 
 
124 aa  100  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4676  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.65 
 
 
121 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0608  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.06 
 
 
124 aa  100  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581475  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03416  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
118 aa  100  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.6 
 
 
122 aa  100  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01609  HesB protein family  47.17 
 
 
116 aa  100  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.6 
 
 
122 aa  100  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12232  hypothetical protein  47.54 
 
 
118 aa  100  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000227512  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0725  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.65 
 
 
120 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2571  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.23 
 
 
113 aa  100  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.37717  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002592  probable iron binding protein from the HesB_IscA_SufA family  46.23 
 
 
113 aa  100  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000217279  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1095  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
120 aa  100  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00345667  decreased coverage  0.0031611 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14110  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.69 
 
 
118 aa  100  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00155  hypothetical protein  47.17 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0844393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3446  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.17 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1203  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.592429  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0160  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0227  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2665  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.04 
 
 
117 aa  99.4  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840353  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00154  hypothetical protein  47.17 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0585219  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3349  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
115 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1044  HesB/YadR/YfhF  45.87 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0515022  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5101  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.71 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105722  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0168  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0242  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132384  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3503  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.911053  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0224  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0241  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0609  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.54 
 
 
121 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000901773  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3352  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.54 
 
 
121 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00016934  hitchhiker  0.0000376167 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0148  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0166  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
108 aa  99.4  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0161  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0225  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0632287  normal  0.831561 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1304  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
108 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0985  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
116 aa  99.4  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243012  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3121  HesB/YadR/YfhF  47.75 
 
 
120 aa  99  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1123  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
116 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4770  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.79 
 
 
132 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00616694  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1442  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.54 
 
 
124 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402332  hitchhiker  0.0055287 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2815  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.23 
 
 
116 aa  99  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0995979  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.06 
 
 
116 aa  99  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3153  putative HesB-like protein  46.85 
 
 
121 aa  99.4  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937161 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2562  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.54 
 
 
121 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000254091  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3302  HesB/YadR/YfhF  48.15 
 
 
120 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3313  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.15 
 
 
120 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2889  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
116 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113097  hitchhiker  0.000000819699 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2971  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
116 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141042  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2494  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
121 aa  99  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.686511  normal  0.176727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3067  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
116 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0351916  hitchhiker  0.000000150734 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3364  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.15 
 
 
120 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0837233 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3101  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.23 
 
 
115 aa  98.6  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>