More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0212 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 728 aa  1403    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  45.92 
 
 		 766 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  46.87 
 
 		 742 aa  544  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 		 760 aa  524  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  38.56 
 
 		 801 aa  514  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  40.08 
 
 		 910 aa  489  1e-137  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 		 796 aa  483  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  39.86 
 
 		 888 aa  475  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 878 aa  475  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  38.33 
 
 		 922 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  50.48 
 
 		 870 aa  455  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  47.51 
 
 		 792 aa  451  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  43.19 
 
 		 942 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  44.97 
 
 		 937 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  44.97 
 
 		 937 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  45.14 
 
 		 819 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 		 822 aa  420  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  44.14 
 
 		 925 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 		 934 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  42.86 
 
 		 934 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  43.65 
 
 		 927 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  43.27 
 
 		 927 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  43.79 
 
 		 911 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  35.94 
 
 		 769 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  36.38 
 
 		 769 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 		 770 aa  405  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  42.36 
 
 		 928 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  40.26 
 
 		 610 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  35.94 
 
 		 769 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 607 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 935 aa  398  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 1063 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 		 916 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 		 921 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  42.49 
 
 		 916 aa  395  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 921 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  39.97 
 
 		 603 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  35.76 
 
 		 774 aa  390  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 598 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  38.9 
 
 		 604 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  35.96 
 
 		 770 aa  386  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  36.8 
 
 		 770 aa  387  1e-106  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  38.8 
 
 		 601 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 606 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 812 aa  369  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  39.08 
 
 		 1104 aa  363  8e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  44.78 
 
 		 713 aa  356  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  44.94 
 
 		 803 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  42.72 
 
 		 785 aa  350  8e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  38.96 
 
 		 552 aa  348  3e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  38.96 
 
 		 552 aa  348  3e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  43.58 
 
 		 783 aa  346  1e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  46.86 
 
 		 743 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  46.86 
 
 		 747 aa  344  4e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  46.6 
 
 		 747 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  45.55 
 
 		 737 aa  342  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 1031 aa  342  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  46.39 
 
 		 754 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  45.66 
 
 		 748 aa  341  4e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  45.91 
 
 		 681 aa  339  9e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  46.34 
 
 		 739 aa  339  9e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  45.66 
 
 		 758 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 		 666 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 730 aa  337  3.9999999999999995e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  44.03 
 
 		 685 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  45.55 
 
 		 748 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  38.6 
 
 		 625 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  45.55 
 
 		 753 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  45.01 
 
 		 1089 aa  334  3e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 871 aa  333  5e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  43.6 
 
 		 660 aa  333  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  36.17 
 
 		 639 aa  333  7.000000000000001e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 759 aa  332  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  41.71 
 
 		 767 aa  332  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 673 aa  332  2e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  44.76 
 
 		 671 aa  331  4e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  38.24 
 
 		 714 aa  330  6e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  41.27 
 
 		 751 aa  330  6e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  39.12 
 
 		 736 aa  330  7e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 		 954 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 		 673 aa  329  1.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 		 741 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 		 719 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1740  CheA signal transduction histidine kinases  37.3 
 
 		 807 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0607216 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  40.04 
 
 		 747 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2285  CheA signal transduction histidine kinases  34.02 
 
 		 584 aa  327  4.0000000000000003e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0990  CheA signal transduction histidine kinase  44.65 
 
 		 1085 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3199  chemotaxis protein CheA  38.64 
 
 		 561 aa  327  5e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 747 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 		 746 aa  326  9e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 		 687 aa  325  2e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  44.5 
 
 		 691 aa  325  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  43.67 
 
 		 762 aa  325  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 		 650 aa  324  3e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 		 675 aa  324  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 		 666 aa  324  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 558 aa  324  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  47.4 
 
 		 679 aa  324  4e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 		 746 aa  324  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 741 aa  324  4e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>