More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0201 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  100 
 
 		 347 aa  681    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  47.41 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  51.84 
 
 		 392 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  48.4 
 
 		 402 aa  210  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  50.42 
 
 		 257 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4321  histidine kinase  49.28 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  50 
 
 		 465 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  41.86 
 
 		 401 aa  206  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  49.6 
 
 		 425 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  48.54 
 
 		 397 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0653  histidine kinase  42.26 
 
 		 392 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0660  histidine kinase  42.26 
 
 		 392 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0673  histidine kinase  42.26 
 
 		 392 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.692637 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 		 594 aa  202  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  49.23 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  47.08 
 
 		 422 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  47.74 
 
 		 537 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 		 581 aa  199  5e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 		 581 aa  199  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  42.2 
 
 		 581 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  49.39 
 
 		 416 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 		 399 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  48.1 
 
 		 414 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03690  histidine kinase  45.7 
 
 		 398 aa  196  5.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.156811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3817  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 392 aa  196  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.59485  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  48.24 
 
 		 412 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 		 585 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  42.19 
 
 		 571 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  46.18 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 		 458 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 460 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  45.56 
 
 		 406 aa  193  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  44.58 
 
 		 599 aa  193  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2909  sensor histidine kinase  49.63 
 
 		 377 aa  192  7e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  41.42 
 
 		 571 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  44.49 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  44.57 
 
 		 394 aa  190  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  47.39 
 
 		 397 aa  189  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  34.97 
 
 		 587 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  41.2 
 
 		 581 aa  189  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  35.63 
 
 		 587 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  46.89 
 
 		 409 aa  189  8e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.91 
 
 		 584 aa  189  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 584 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  39.77 
 
 		 587 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  35.63 
 
 		 587 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 		 587 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  39.77 
 
 		 587 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 608 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0996  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  39.39 
 
 		 587 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 589 aa  186  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  39.39 
 
 		 587 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0579  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 		 401 aa  186  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  39.39 
 
 		 587 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  39.39 
 
 		 587 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 		 592 aa  185  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0895  histidine kinase  45.76 
 
 		 435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0538379  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  45.17 
 
 		 393 aa  184  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 585 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 582 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0336  histidine kinase  49.4 
 
 		 410 aa  182  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  45.93 
 
 		 591 aa  182  9.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0403  histidine kinase  49.8 
 
 		 425 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335965 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  41.98 
 
 		 575 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  44.73 
 
 		 387 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  43.58 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1074  signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 443 aa  180  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4930  histidine kinase  47.2 
 
 		 397 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 		 423 aa  179  8e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 		 446 aa  179  9e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 589 aa  178  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 		 590 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2215  histidine kinase  40.84 
 
 		 356 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 587 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10498  two component system sensor histidine kinase senX3  38.87 
 
 		 410 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.19354e-61  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4045  ATPase domain-containing protein  47.89 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3543  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 478 aa  175  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 815 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 456 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 554 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  38.33 
 
 		 554 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  38.66 
 
 		 565 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 597 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1099  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 430 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000024984 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 489 aa  172  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  39.36 
 
 		 584 aa  173  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1922  signal transduction histidine kinase sensor  41.87 
 
 		 363 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0196  histidine kinase  42.44 
 
 		 510 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.447748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 608 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 		 623 aa  172  9e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  44.32 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  39.51 
 
 		 598 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2968  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 439 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000115911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.51 
 
 		 571 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 607 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 		 590 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 599 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 597 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>