More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0142 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  100 
 
 		 370 aa  714    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  56.45 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  52.42 
 
 		 325 aa  249  6e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  45.98 
 
 		 368 aa  229  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  48.68 
 
 		 318 aa  223  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  52.54 
 
 		 174 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  48.84 
 
 		 191 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  55 
 
 		 199 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  54.55 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  53.91 
 
 		 438 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  50.86 
 
 		 235 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  49.25 
 
 		 442 aa  118  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  52 
 
 		 189 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  48.21 
 
 		 261 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  53.72 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  52.21 
 
 		 217 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  48.65 
 
 		 261 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  54.21 
 
 		 452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  48.65 
 
 		 261 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  47.75 
 
 		 261 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  46.09 
 
 		 238 aa  116  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  46.85 
 
 		 261 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  46.85 
 
 		 261 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  46.85 
 
 		 261 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  46.85 
 
 		 261 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  55.45 
 
 		 206 aa  115  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  44.22 
 
 		 228 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  51.3 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  51.82 
 
 		 191 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  45.04 
 
 		 222 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  42.13 
 
 		 194 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  46.85 
 
 		 259 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  46.85 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  50.39 
 
 		 196 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  44.26 
 
 		 199 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  48.33 
 
 		 195 aa  113  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  49.61 
 
 		 212 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  52.31 
 
 		 218 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  50.48 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  42.18 
 
 		 188 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  50.83 
 
 		 207 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  42.48 
 
 		 215 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  43.45 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  43.45 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  57.66 
 
 		 218 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  55 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  52.5 
 
 		 244 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  55.56 
 
 		 218 aa  110  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  47.5 
 
 		 217 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  47.5 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  47.27 
 
 		 202 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  49.53 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  53.06 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  46.72 
 
 		 261 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  44.26 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  48.21 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  41.89 
 
 		 206 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  39.72 
 
 		 202 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  49.57 
 
 		 194 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  43.44 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  47.62 
 
 		 328 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  45.9 
 
 		 204 aa  106  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  53.12 
 
 		 216 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  37.84 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  54.74 
 
 		 556 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  47.62 
 
 		 204 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 215 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  45.22 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  46.72 
 
 		 154 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  47.27 
 
 		 189 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  47.01 
 
 		 204 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  46.72 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  45.08 
 
 		 204 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3973  lytic transglycosylase catalytic  54.46 
 
 		 204 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  52.38 
 
 		 278 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  45.3 
 
 		 200 aa  102  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  49.57 
 
 		 366 aa  102  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0406  Lytic transglycosylase catalytic  47.9 
 
 		 258 aa  102  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  0.0556667 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  47.27 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  54.9 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 234 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  57.47 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  53.47 
 
 		 259 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  46 
 
 		 535 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  51.04 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3638  lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 206 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.237 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  44.26 
 
 		 198 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  42.42 
 
 		 204 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50.47 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  50.49 
 
 		 354 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  48.94 
 
 		 487 aa  101  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  41.22 
 
 		 146 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  49.02 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 242 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  52.38 
 
 		 271 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  48.15 
 
 		 202 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>