More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0111 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0111  aspartate kinase  100 
 
 
411 aa  813    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357195  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2012  aspartate kinase  58.88 
 
 
422 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.506578  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0282  aspartate kinase  57.24 
 
 
434 aa  456  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0463  aspartate kinase  59.62 
 
 
446 aa  451  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0419  aspartate kinase  59.18 
 
 
424 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4886  aspartate kinase  59.41 
 
 
422 aa  450  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3528  aspartate kinase  59.37 
 
 
424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305275  normal  0.739035 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3119  aspartate kinase  60.73 
 
 
421 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000795424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1304  aspartate kinase  58.68 
 
 
440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.928497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5257  aspartate kinase  58.33 
 
 
421 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4889  aspartate kinase  58.33 
 
 
421 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.213019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4978  aspartate kinase  58.33 
 
 
421 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.922524  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04740  aspartate kinase  56.94 
 
 
435 aa  438  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.356353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9025  aspartate kinase  59.51 
 
 
422 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5504  aspartate kinase  57.95 
 
 
421 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0983688 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0552  aspartate kinase  59.62 
 
 
452 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9311  Aspartate kinase  58.15 
 
 
424 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202676  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0321  aspartate kinase  57.87 
 
 
424 aa  437  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.559818  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0043  aspartate kinase  58.54 
 
 
423 aa  434  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0217  aspartate kinase  58.19 
 
 
421 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0262  aspartate kinase  61.03 
 
 
422 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0462  aspartate kinase  57.42 
 
 
421 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0504  aspartate kinase  57.6 
 
 
422 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6573  aspartate kinase  61.03 
 
 
422 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0689  aspartate kinase  58.65 
 
 
452 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02610  aspartate kinase  58.37 
 
 
428 aa  431  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36380  aspartate kinase  57.84 
 
 
420 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.881518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0559  aspartate kinase  58.39 
 
 
424 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4813  aspartate kinase  56.59 
 
 
423 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13741  aspartate kinase  57.6 
 
 
421 aa  426  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.500059  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3982  aspartate kinase  57.21 
 
 
421 aa  422  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04060  aspartate kinase  54.68 
 
 
427 aa  422  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.53456 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1370  aspartate kinase  53.32 
 
 
407 aa  422  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0493  aspartate kinase  55.64 
 
 
421 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.481845  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2702  aspartate kinase  54.19 
 
 
426 aa  419  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0694  aspartate kinase  56.97 
 
 
421 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0265  aspartate kinase  57.18 
 
 
421 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.472998  hitchhiker  0.00161342 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  53.07 
 
 
409 aa  412  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1167  aspartate kinase  53.71 
 
 
412 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000835866  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0226  aspartate kinase  57.11 
 
 
421 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1378  aspartate kinase  51.23 
 
 
405 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000455127  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  54.34 
 
 
411 aa  409  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5290  aspartate kinase  57.14 
 
 
415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1515  aspartate kinase, monofunctional class  50.99 
 
 
405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000110315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  51.23 
 
 
410 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  51.12 
 
 
403 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1633  aspartate kinase  50.99 
 
 
405 aa  404  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000255158  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  50.73 
 
 
411 aa  401  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  50.37 
 
 
405 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  51.11 
 
 
424 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  50.12 
 
 
406 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  51.58 
 
 
412 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  51.46 
 
 
411 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  51.11 
 
 
410 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  51.36 
 
 
410 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  51.36 
 
 
405 aa  398  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  50.24 
 
 
411 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  53.94 
 
 
412 aa  398  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  51.58 
 
 
412 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  49.38 
 
 
427 aa  395  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  50.24 
 
 
411 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  50.62 
 
 
407 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  50.24 
 
 
411 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0773  aspartate kinase  50 
 
 
406 aa  394  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117085  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  50.86 
 
 
408 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  53.2 
 
 
409 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28320  aspartate kinase  52.26 
 
 
455 aa  391  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  50.25 
 
 
400 aa  388  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  50.37 
 
 
401 aa  389  1e-107  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  53.45 
 
 
408 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  50.62 
 
 
404 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  53.45 
 
 
408 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  49.14 
 
 
413 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  50 
 
 
413 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1304  aspartate kinase  52.96 
 
 
405 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.506172 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  50.87 
 
 
405 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  46.9 
 
 
428 aa  385  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0787  aspartate kinase  49.62 
 
 
404 aa  385  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  46.43 
 
 
428 aa  383  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2048  aspartate kinase  48.16 
 
 
409 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2117  aspartate kinase  50.37 
 
 
404 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.203177 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  51.72 
 
 
409 aa  383  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  49.02 
 
 
408 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0884  aspartate kinase  54.48 
 
 
408 aa  382  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000337521  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1075  aspartate kinase  53.87 
 
 
410 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352103  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2531  aspartate kinase  49.88 
 
 
404 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000021173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  51.85 
 
 
409 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  48.15 
 
 
400 aa  379  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  51.73 
 
 
416 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  50.86 
 
 
416 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  48.14 
 
 
400 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  49.14 
 
 
408 aa  376  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  49.38 
 
 
413 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  47.89 
 
 
400 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1145  aspartate kinase  49.29 
 
 
599 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2173  aspartate kinase  51.34 
 
 
417 aa  375  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0966  aspartate kinase  49.14 
 
 
418 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227813  hitchhiker  0.000505058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3243  aspartate kinase  50.84 
 
 
601 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  49.76 
 
 
414 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2262  aspartate kinase  49.38 
 
 
404 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000147386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>